Als «lme4-nlme» getaggte Fragen

lme4 und nlme sind R-Pakete, die zum Anpassen linearer, verallgemeinerter linearer und nichtlinearer Modelle mit gemischten Effekten verwendet werden. Verwenden Sie für allgemeine Fragen zu gemischten Modellen das Tag [gemischtes Modell].

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R / mgcv: Warum produzieren te () und ti () Tensorprodukte unterschiedliche Oberflächen?
Das mgcvPaket für Rhat zwei Funktionen zum Anpassen von Tensorproduktwechselwirkungen: te()und ti(). Ich verstehe die grundlegende Arbeitsteilung zwischen den beiden (Anpassen einer nichtlinearen Wechselwirkung vs. Zerlegen dieser Wechselwirkung in Haupteffekte und eine Wechselwirkung). Was ich nicht verstehe, ist warum te(x1, x2)und ti(x1) + ti(x2) + ti(x1, x2)kann (leicht) unterschiedliche Ergebnisse …
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Testen simultaner und verzögerter Effekte in longitudinalen gemischten Modellen mit zeitlich variierenden Kovariaten
Kürzlich wurde mir gesagt, dass es nicht möglich ist, zeitvariable Kovariaten in longitudinale gemischte Modelle einzubeziehen, ohne eine Zeitverzögerung für diese Kovariaten einzuführen. Können Sie dies bestätigen / ablehnen? Haben Sie Hinweise zu dieser Situation? Ich schlage eine einfache Situation zur Klärung vor. Angenommen, ich habe quantitative Messungen (etwa 30 …
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Wiederholte Maßnahmen anova: lm vs lmer
Ich versuche, mehrere Interaktionstests zwischen beiden lmund lmerwiederholten Messungen (2x2x2) zu reproduzieren. Der Grund, warum ich beide Methoden vergleichen möchte, ist, dass das GLM von SPSS für wiederholte Messungen genau die gleichen Ergebnisse liefert wie der lmhier vorgestellte Ansatz. Am Ende möchte ich SPSS mit R-lmer vergleichen. Bisher habe ich …
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Modellmatrizen für Modelle mit gemischten Effekten
In der lmerFunktion in lme4in Rgibt es einen Aufruf zum Erstellen einer Modellmatrix von Zufallseffekten , wie hier auf den Seiten 7 bis 9 erläutert .ZZZ Die Berechnung von beinhaltet KhatriRao- und / oder Kronecker-Produkte aus zwei Matrizen, J_i und X_i . ZZZJiJiJ_iXiXiX_i Die Matrix JiJiJ_i ist ein Schluck: "Indikatormatrix …
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Post-hoc-Tests in multcomp :: glht für Modelle mit gemischten Effekten (lme4) mit Wechselwirkungen
Ich führe Post-hoc-Tests an einem linearen Mischeffektmodell in R( lme4Paket) durch. Ich verwende multcompPaket ( glht()Funktion), um die Post-Hoc-Tests durchzuführen. Mein experimenteller Entwurf besteht aus wiederholten Messungen mit einem zufälligen Blockeffekt. Die Modelle sind wie folgt spezifiziert: mymod <- lmer(variable ~ treatment * time + (1|block), data = mydata, REML …
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Intraclass-Korrelationskoeffizient im gemischten Modell mit zufälligen Steigungen
Ich habe das folgende Modell , m_plotausgestattet mit lme4::lmermit gekreuzten zufälligen Effekten für die Teilnehmer ( lfdn) und Artikel ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366 7.236 -0.05 0.17 -0.83 inference3 21.295 4.615 …
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Notation für die Mehrebenenmodellierung
Die Formel, die man für das Training eines Mehrebenenmodells ( lmeraus der lme4 RBibliothek) angeben muss, bringt mich immer weiter. Ich habe unzählige Lehrbücher und Tutorials gelesen, aber nie richtig verstanden. Hier ist ein Beispiel aus diesem Tutorial , das ich gerne in einer Gleichung formuliert sehen würde. Wir versuchen, …
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Sind Freiheitsgrade in lmerTest :: anova korrekt? Sie unterscheiden sich sehr von RM-ANOVA
Ich analysiere die Ergebnisse eines Reaktionszeitversuchs in R. Ich führte eine ANOVA mit wiederholten Messungen durch (1 Faktor innerhalb des Subjekts mit 2 Stufen und 1 Faktor zwischen den Subjekten mit 2 Stufen). Ich habe ein ähnliches lineares gemischtes Modell ausgeführt und wollte die früheren Ergebnisse in Form einer ANOVA-Tabelle …
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So erhalten Sie das Konfidenzintervall für die Änderung des Populations-R-Quadrats
Als einfaches Beispiel wird angenommen, dass es zwei lineare Regressionsmodelle gibt Modell 1 hat drei Prädiktoren x1a, x2bundx2c Modell 2 hat drei Prädiktoren aus Modell 1 und zwei zusätzliche Prädiktoren x2aundx2b Es gibt eine Populationsregressionsgleichung, bei der die erklärte Populationsvarianz für Modell 1 für Modell 2 . Die durch Modell …
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Wie kann man die Koeffizienten eines multivariaten gemischten Modells in lme4 ohne Gesamtabschnitt interpretieren?
Ich versuche, ein multivariates (dh Mehrfachantwort-) Mischmodell einzubauen R. Abgesehen von den ASReml-rund SabreR-Paketen (für die externe Software erforderlich ist) scheint dies nur in möglich zu sein MCMCglmm. In dem Papier , das die begleitet MCMCglmmPaket (pp.6) beschreibt Jarrod Hadfield den Prozess des Anpassens ein solches Modell , wie wie …
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Hierarchische Modelle für mehrere Vergleiche - Kontext mit mehreren Ergebnissen
Ich habe gerade Gelman's (erneut) gelesen. Warum wir uns (normalerweise) nicht um mehrere Vergleiche kümmern müssen . Insbesondere wird im Abschnitt "Mehrere Ergebnisse und andere Herausforderungen" die Verwendung eines hierarchischen Modells für Situationen erwähnt, in denen mehrere verwandte Maßnahmen von derselben Person / Einheit zu unterschiedlichen Zeiten / Bedingungen vorliegen. …
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