Als «lme4-nlme» getaggte Fragen

lme4 und nlme sind R-Pakete, die zum Anpassen linearer, verallgemeinerter linearer und nichtlinearer Modelle mit gemischten Effekten verwendet werden. Verwenden Sie für allgemeine Fragen zu gemischten Modellen das Tag [gemischtes Modell].

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Wie kann ein Post-hoc-Vergleich des Interaktionsterms mit dem Mixed-Effects-Modell durchgeführt werden?
Ich arbeite an einem Datensatz, um die Auswirkungen des Trocknens auf die mikrobiellen Aktivitäten von Sedimenten zu bewerten. Ziel ist es festzustellen, ob die Auswirkungen des Trocknens zwischen den Sedimenttypen und / oder der Tiefe innerhalb des Sediments variieren. Der Versuchsaufbau ist wie folgt: Der erste Faktor Sediment entspricht drei …
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Vergleich eines gemischten Modells (Subjekt als Zufallseffekt) mit einem einfachen linearen Modell (Subjekt als fester Effekt)
Ich beende eine Analyse eines großen Datensatzes. Ich möchte das im ersten Teil der Arbeit verwendete lineare Modell verwenden und es mithilfe eines linearen gemischten Modells (LME) neu anpassen. Die LME wäre sehr ähnlich, mit der Ausnahme, dass eine der im Modell verwendeten Variablen als zufälliger Effekt verwendet würde. Diese …
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Warum würden Sie aus einem Mischeffektmodell vorhersagen, ohne zufällige Effekte für die Vorhersage einzubeziehen?
Dies ist eher eine konzeptionelle Frage, aber während ich sie verwende, werde Rich auf die Pakete in verweisen R. Wenn das Ziel darin besteht, ein lineares Modell für Vorhersagezwecke anzupassen und dann Vorhersagen zu treffen, bei denen die zufälligen Effekte möglicherweise nicht verfügbar sind, hat die Verwendung eines Modells mit …
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P-Wert für den Interaktionsterm in Modellen mit gemischten Effekten unter Verwendung von lme4
Ich analysiere einige Verhaltensdaten mit lme4in R, hauptsächlich nach Bodo Winters hervorragenden Tutorials , aber ich verstehe nicht, ob ich mit Interaktionen richtig umgehe. Schlimmer noch, niemand anderes, der an dieser Forschung beteiligt ist, verwendet gemischte Modelle. Ich bin also ein bisschen treibend, wenn es darum geht, sicherzustellen, dass die …
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REML vs ML stepAIC
Ich fühle mich überwältigt, nachdem ich versucht habe, mich mit der Literatur zu befassen, wie ich meine gemischte Modellanalyse durchführen kann, um anschließend mit AIC das beste Modell oder die besten Modelle auszuwählen. Ich denke nicht, dass meine Daten so kompliziert sind, aber ich suche nach einer Bestätigung, dass das, …
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lmer mit mehrfach unterstellten Daten
Wie kann ich nach mehrfacher Imputation gepoolte Zufallseffekte für lmer erhalten? Ich benutze Mäuse, um einen Datenrahmen mehrfach zu unterstellen. Und lme4 für ein gemischtes Modell mit zufälligem Achsenabschnitt und zufälliger Steigung. Das Pooling von lmer ist in Ordnung, außer dass die zufälligen Effekte nicht gepoolt werden. Ich habe viel …
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Bakterien, die nach mehreren Oberflächenkontakten an den Fingern aufgenommen wurden: nicht normale Daten, wiederholte Messungen, gekreuzte Teilnehmer
Intro Ich habe Teilnehmer, die unter zwei Bedingungen wiederholt kontaminierte Oberflächen mit E. coli berühren ( A = Handschuhe tragen, B = keine Handschuhe). Ich möchte wissen, ob es einen Unterschied zwischen der Menge an Bakterien auf ihren Fingerspitzen mit und ohne Handschuhe gibt, aber auch zwischen der Anzahl der …
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Was tun mit einer Korrelation mit zufälligen Effekten, die gleich 1 oder -1 ist?
Das nicht so seltene Auftreten bei komplexen maximal gemischten Modellen (Schätzung aller möglichen zufälligen Effekte für bestimmte Daten und Modelle) ist eine perfekte (+1 oder -1) oder nahezu perfekte Korrelation zwischen einigen zufälligen Effekten. Betrachten wir zum Zweck der Diskussion das folgende Modell und die folgende Modellzusammenfassung Model: Y ~ …
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Hilfe bei der Interpretation von Zähldaten GLMM mit lme4 glmer und glmer.nb - Negatives Binomial gegenüber Poisson
Ich habe einige Fragen zur Spezifikation und Interpretation von GLMMs. 3 Fragen sind definitiv statistisch und 2 beziehen sich genauer auf R. Ich poste hier, weil ich letztendlich denke, dass das Problem die Interpretation der GLMM-Ergebnisse ist. Ich versuche gerade, ein GLMM zu montieren. Ich verwende US-Volkszählungsdaten aus der Longitudinal …
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Modell mit gemischten Effekten und Splines
Ich passe ein Modell mit gemischten Effekten mit einem Spline-Term in einer Anwendung an, bei der der zeitliche Trend bekanntermaßen kurvenlinear ist. Ich möchte jedoch beurteilen, ob der kurvenlineare Trend aufgrund einer individuellen Abweichung von der Linearität auftritt oder ob es sich um einen Effekt auf Gruppenebene handelt, der eine …
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