lme4 und nlme sind R-Pakete, die zum Anpassen linearer, verallgemeinerter linearer und nichtlinearer Modelle mit gemischten Effekten verwendet werden. Verwenden Sie für allgemeine Fragen zu gemischten Modellen das Tag [gemischtes Modell].
In diesem Forum wird viel darüber diskutiert, wie verschiedene hierarchische Modelle richtig angegeben werden können lmer. Ich dachte, es wäre großartig, alle Informationen an einem Ort zu haben. Ein paar Fragen zum Starten: So legen Sie mehrere Ebenen fest, in denen eine Gruppe in der anderen verschachtelt ist: (1|group1:group2)oder (1+group1|group2)? …
Hier ist, wie ich verschachtelte vs. gekreuzte zufällige Effekte verstanden habe: Verschachtelte zufällige Effekte treten auf, wenn ein Faktor der unteren Ebene nur innerhalb einer bestimmten Ebene eines Faktors der oberen Ebene erscheint. Zum Beispiel Schüler in Klassen zu einem festgelegten Zeitpunkt. In lme4ich dachte , dass wir die zufälligen …
Wenn wir einen Glimmer nachrüsten, erhalten wir möglicherweise eine Warnung, die uns mitteilt, dass das Modell Schwierigkeiten hat, sich anzunähern ... z >Warning message: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, : Model failed to converge with max|grad| = 0.00389462 (tol = 0.001) Eine andere Möglichkeit, die Konvergenz zu überprüfen, …
Die Anpassung einer logistischen Regression mit lme4 endet mit Error in mer_finalize(ans) : Downdated X'X is not positive definite. Eine wahrscheinliche Ursache für diesen Fehler ist offenbar ein Rangmangel. Was ist ein Rangmangel und wie soll ich damit umgehen?
Ich habe ein paar gemischten Effekte für Modelle (insbesondere Längs Modelle) mit lme4in Rmöchte aber wirklich um die Modelle beherrschen und den Code, der mit sich geht. Bevor ich jedoch mit beiden Beinen eintauche (und ein paar Bücher kaufe), möchte ich sicher sein, dass ich die richtige Bibliothek lerne. Ich …
Ich benutze lme4 in R, um das gemischte Modell zu passen lmer(value~status+(1|experiment))) Wo Wert stetig ist, sind Status und Experiment Faktoren, und ich verstehe Linear mixed model fit by REML Formula: value ~ status + (1 | experiment) AIC BIC logLik deviance REMLdev 29.1 46.98 -9.548 5.911 19.1 Random effects: …
Früher dachte ich, dass das "Zufallseffektmodell" in der Ökonometrie einem "gemischten Modell mit zufälligem Schnitt" außerhalb der Ökonometrie entspricht, aber jetzt bin ich mir nicht sicher. Macht es? In der Ökonometrie werden Begriffe wie "feste Effekte" und "zufällige Effekte" etwas anders verwendet als in der Literatur zu gemischten Modellen, was …
Kürzlich habe ich gemessen, wie die Bedeutung eines neuen Wortes bei wiederholten Expositionen (Praxis: Tag 1 bis Tag 10) durch Messen von ERPs (EEGs) ermittelt wird, wenn das Wort in verschiedenen Kontexten betrachtet wurde. Ich kontrollierte auch die Eigenschaften des Kontexts, zum Beispiel seine Nützlichkeit für die Entdeckung der neuen …
Ich frage mich, ob es einen Unterschied in der Interpretation macht, ob nur die abhängigen, sowohl die abhängigen als auch die unabhängigen Variablen oder nur die unabhängigen Variablen log-transformiert werden. Betrachten Sie den Fall von log(DV) = Intercept + B1*IV + Error Ich kann die IV als prozentuale Erhöhung interpretieren, …
EDIT 2: Ursprünglich dachte ich, ich müsste eine Zweifaktor-ANOVA mit wiederholten Messungen für einen Faktor durchführen, aber jetzt denke ich, dass ein lineares Mischeffektmodell für meine Daten besser funktioniert. Ich glaube, ich weiß fast, was passieren muss, aber ich bin immer noch durch einige Punkte verwirrt. Die Experimente, die ich …
Numerisch die Ableitung MLE s von GLMM schwierig ist und in der Praxis, ich weiß, wir sollten nicht Brute - Force - Optimierung verwenden (zB mit optimauf einfache Art und Weise). Aus pädagogischen Gründen möchte ich es jedoch versuchen, um sicherzustellen, dass ich das Modell richtig verstehe (siehe folgenden Code). …
Ich möchte ein Vorhersageintervall für eine Vorhersage aus einem lmer () -Modell erhalten. Ich habe eine Diskussion darüber gefunden: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq Sie scheinen jedoch die Unsicherheit der zufälligen Effekte nicht zu berücksichtigen. Hier ist ein konkretes Beispiel. Ich rase Goldfisch. Ich habe Daten zu den letzten 100 Rennen. Ich möchte …
Effectspackage bietet eine sehr schnelle und bequeme Möglichkeit , lineare Mischeffekt-Modellergebnisse zu zeichnen, die mit lme4package erhalten wurden . Die effectFunktion berechnet Konfidenzintervalle (CIs) sehr schnell, aber wie vertrauenswürdig sind diese Konfidenzintervalle? Beispielsweise: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength ~ batch + (1 | cask), Pastes) effs <- as.data.frame(effect(c("batch"), …
Kürzlich wurde mir klar, dass ein gemischtes Modell mit nur einem Subjekt als Zufallsfaktor und den anderen Faktoren als festen Faktoren einer ANOVA entspricht, wenn die Korrelationsstruktur des gemischten Modells auf zusammengesetzte Symmetrie eingestellt wird. Daher möchte ich wissen, was Verbindungssymmetrie im Kontext einer gemischten (dh aufgeteilten) ANOVA bedeutet, bestenfalls …
Ich habe Daten aus einem Experiment gesammelt, das wie folgt organisiert ist: Zwei Standorte mit jeweils 30 Bäumen. 15 werden behandelt, 15 werden an jeder Stelle kontrolliert. Von jedem Baum nehmen wir drei Stängelstücke und drei Wurzelstücke, also 6 Proben der Stufe 1 pro Baum, die durch eine von zwei …
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