Als «lme4-nlme» getaggte Fragen

lme4 und nlme sind R-Pakete, die zum Anpassen linearer, verallgemeinerter linearer und nichtlinearer Modelle mit gemischten Effekten verwendet werden. Verwenden Sie für allgemeine Fragen zu gemischten Modellen das Tag [gemischtes Modell].


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Wie passe ich ein Mehrebenenmodell für übermäßig verteilte Poisson-Ergebnisse an?
Ich möchte ein mehrstufiges GLMM mit einer Poisson-Verteilung (mit Überdispersion) unter Verwendung von R ausrüsten. Im Moment verwende ich lme4, aber mir ist aufgefallen, dass die quasipoissonFamilie kürzlich entfernt wurde. Ich habe an anderer Stelle gesehen, dass Sie additive Überdispersion für Binomialverteilungen modellieren können, indem Sie einen zufälligen Achsenabschnitt mit …


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Ich und ich im Vergleich
Ich habe mich gefragt, ob mich jemand über die aktuellen Unterschiede zwischen diesen beiden Funktionen aufklären könnte. Ich fand die folgende Frage: Wie wähle ich die Bibliothek nlme oder lme4 R für Modelle mit gemischten Effekten? , aber das stammt aus ein paar Jahren. Das ist ein Leben lang in …

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Wie erhält man einen "gesamten" p-Wert und eine Effektgröße für einen kategorialen Faktor in einem gemischten Modell (lme4)?
Ich möchte einen p-Wert und eine Effektgröße einer unabhängigen kategorialen Variablen (mit mehreren Ebenen) erhalten - das ist "insgesamt" und nicht für jede Ebene separat, wie es die normale Ausgabe von lme4in R ist. Es ist genau wie das, was die Leute berichten, wenn sie eine ANOVA betreiben. Wie kann …

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Welche praktischen Auswirkungen hat das Schätzen in einem mehrstufigen Modell im Vergleich zum Nichtschätzen von Korrelationsparametern für zufällige Effekte?
Welche praktischen und interpretationsbezogenen Auswirkungen hat das Schätzen in einem mehrstufigen Modell im Vergleich zum Nichtschätzen von Korrelationsparametern für zufällige Effekte? Der praktische Grund, dies zu erfragen, ist, dass es im früheren Framework in R keine implementierte Methode zum Schätzen von p-Werten über MCMC-Techniken gibt, wenn Schätzungen im Modell der …

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Beispielberichte für eine Mixed-Model-Analyse unter Verwendung von Lmer in Biologie, Psychologie und Medizin?
Da der allgemeine Konsens darin zu bestehen scheint, gemischte Modelle über lmer()in R anstelle der klassischen ANOVA zu verwenden (aus den häufig genannten Gründen, wie unsymmetrische Designs, gekreuzte Zufallseffekte usw.), möchte ich es mit meinen Daten versuchen. Ich befürchte jedoch, dass ich diesen Ansatz meinem Vorgesetzten (der am Ende eine …

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Kann AIC zwischen verschiedenen Modelltypen vergleichen?
Ich verwende AIC (Akaikes Informationskriterium), um nichtlineare Modelle in R zu vergleichen. Ist es gültig, die AICs verschiedener Modelltypen zu vergleichen? Insbesondere vergleiche ich ein von glm angepasstes Modell mit einem von glmer (lme4) angepassten Ausdruck für zufällige Effekte. Wenn nein, gibt es eine Möglichkeit, einen solchen Vergleich durchzuführen? Oder …

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predict () -Funktion für ältere Mixed-Effects-Modelle
Das Problem: Ich habe in anderen Posts gelesen , predictdie für lmerModelle mit gemischten Effekten {lme4} in [R] nicht verfügbar sind . Ich habe versucht, dieses Thema mit einem Spielzeugdatensatz zu untersuchen ... Hintergrund: Der Datensatz ist aus dieser Quelle angepasst und als ... require(gsheet) data <- read.csv(text = gsheet2text('https://docs.google.com/spreadsheets/d/1QgtDcGJebyfW7TJsB8n6rAmsyAnlz1xkT3RuPFICTdk/edit?usp=sharing', …


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Habe ich mein Modell in lmer korrekt angegeben?
Ich habe viele Hilfeseiten durchsucht und bin immer noch verwirrt darüber, wie kompliziertere verschachtelte Begriffe auch in einem gemischten Modell angegeben werden können. Ich bin auch verwirrt über die Verwendung von :und /und die |Angabe von Wechselwirkungen und Verschachtelungen mit Zufallsfaktoren, die lmer()im lme4Paket in verwendet werden R. Für diese …

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Wann sind gemischte Modelle mit Nullkorrelation theoretisch sinnvoll?
Das folgende Blockzitat von Marktführern auf dem Gebiet der Modellierung gemischter Effekte besagt, dass Koordinatenverschiebungen in Modellen mit keiner Korrelation zwischen Zufallseffekten ('ZCP'-Modelle) die Modellvorhersagen ändern. Aber kann jemand seine Behauptungen näher erläutern oder weiter begründen? Die Aussagen in Frage sind von Bates et al der 2015 Papier auf lme4, …


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Wie kann Multikollinearität in einem gemischten linearen Modell getestet und vermieden werden?
Ich verwende derzeit einige lineare Modelle mit gemischten Effekten. Ich benutze das Paket "lme4" in R. Meine Modelle haben die Form: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Bevor ich meine Modelle ausführte, überprüfte ich die mögliche Multikollinearität zwischen Prädiktoren. Ich habe das gemacht von: …

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Annahmen überprüfen lmer / lme gemischte Modelle in R
Ich habe einen wiederholten Entwurf durchgeführt, bei dem ich 30 Männer und 30 Frauen in drei verschiedenen Aufgaben getestet habe. Ich möchte verstehen, wie unterschiedlich sich Männer und Frauen verhalten und wie das von der jeweiligen Aufgabe abhängt. Ich habe sowohl das lmer- als auch das lme4-Paket verwendet, um dies …

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