lme4 und nlme sind R-Pakete, die zum Anpassen linearer, verallgemeinerter linearer und nichtlinearer Modelle mit gemischten Effekten verwendet werden. Verwenden Sie für allgemeine Fragen zu gemischten Modellen das Tag [gemischtes Modell].
Ich versuche zu verstehen, wann ein zufälliger Effekt verwendet werden soll und wann er nicht erforderlich ist. Ich habe eine Faustregel erhalten, wenn Sie 4 oder mehr Gruppen / Individuen haben, die ich tue (15 einzelne Elche). Einige dieser Elche wurden zwei- oder dreimal für insgesamt 29 Versuche experimentiert. Ich …
Ich möchte ein mehrstufiges GLMM mit einer Poisson-Verteilung (mit Überdispersion) unter Verwendung von R ausrüsten. Im Moment verwende ich lme4, aber mir ist aufgefallen, dass die quasipoissonFamilie kürzlich entfernt wurde. Ich habe an anderer Stelle gesehen, dass Sie additive Überdispersion für Binomialverteilungen modellieren können, indem Sie einen zufälligen Achsenabschnitt mit …
Hoffentlich ist dies eine Frage, die mir hier jemand zur Art der Zerlegung von Quadratsummen aus einem Modell mit gemischten Effekten beantworten kann, das dazu passt lmer(aus dem Paket lme4 R). Zuallererst sollte ich sagen, dass mir die Kontroverse bei der Verwendung dieses Ansatzes bewusst ist, und in der Praxis …
Ich habe mich gefragt, ob mich jemand über die aktuellen Unterschiede zwischen diesen beiden Funktionen aufklären könnte. Ich fand die folgende Frage: Wie wähle ich die Bibliothek nlme oder lme4 R für Modelle mit gemischten Effekten? , aber das stammt aus ein paar Jahren. Das ist ein Leben lang in …
Ich möchte einen p-Wert und eine Effektgröße einer unabhängigen kategorialen Variablen (mit mehreren Ebenen) erhalten - das ist "insgesamt" und nicht für jede Ebene separat, wie es die normale Ausgabe von lme4in R ist. Es ist genau wie das, was die Leute berichten, wenn sie eine ANOVA betreiben. Wie kann …
Welche praktischen und interpretationsbezogenen Auswirkungen hat das Schätzen in einem mehrstufigen Modell im Vergleich zum Nichtschätzen von Korrelationsparametern für zufällige Effekte? Der praktische Grund, dies zu erfragen, ist, dass es im früheren Framework in R keine implementierte Methode zum Schätzen von p-Werten über MCMC-Techniken gibt, wenn Schätzungen im Modell der …
Da der allgemeine Konsens darin zu bestehen scheint, gemischte Modelle über lmer()in R anstelle der klassischen ANOVA zu verwenden (aus den häufig genannten Gründen, wie unsymmetrische Designs, gekreuzte Zufallseffekte usw.), möchte ich es mit meinen Daten versuchen. Ich befürchte jedoch, dass ich diesen Ansatz meinem Vorgesetzten (der am Ende eine …
Ich verwende AIC (Akaikes Informationskriterium), um nichtlineare Modelle in R zu vergleichen. Ist es gültig, die AICs verschiedener Modelltypen zu vergleichen? Insbesondere vergleiche ich ein von glm angepasstes Modell mit einem von glmer (lme4) angepassten Ausdruck für zufällige Effekte. Wenn nein, gibt es eine Möglichkeit, einen solchen Vergleich durchzuführen? Oder …
Das Problem: Ich habe in anderen Posts gelesen , predictdie für lmerModelle mit gemischten Effekten {lme4} in [R] nicht verfügbar sind . Ich habe versucht, dieses Thema mit einem Spielzeugdatensatz zu untersuchen ... Hintergrund: Der Datensatz ist aus dieser Quelle angepasst und als ... require(gsheet) data <- read.csv(text = gsheet2text('https://docs.google.com/spreadsheets/d/1QgtDcGJebyfW7TJsB8n6rAmsyAnlz1xkT3RuPFICTdk/edit?usp=sharing', …
Ich habe folgende Ausgabe: Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept) 0.82453 0.90804 Number of obs: 239, groups: landscape, 45 Fixed effects: …
Ich habe viele Hilfeseiten durchsucht und bin immer noch verwirrt darüber, wie kompliziertere verschachtelte Begriffe auch in einem gemischten Modell angegeben werden können. Ich bin auch verwirrt über die Verwendung von :und /und die |Angabe von Wechselwirkungen und Verschachtelungen mit Zufallsfaktoren, die lmer()im lme4Paket in verwendet werden R. Für diese …
Das folgende Blockzitat von Marktführern auf dem Gebiet der Modellierung gemischter Effekte besagt, dass Koordinatenverschiebungen in Modellen mit keiner Korrelation zwischen Zufallseffekten ('ZCP'-Modelle) die Modellvorhersagen ändern. Aber kann jemand seine Behauptungen näher erläutern oder weiter begründen? Die Aussagen in Frage sind von Bates et al der 2015 Papier auf lme4, …
Das lmerTestPaket bietet eine anova()Funktion für lineare gemischte Modelle mit optionaler Satterthwaite- (Standard) oder Kenward-Roger-Näherung der Freiheitsgrade (df). Was ist der Unterschied zwischen diesen beiden Ansätzen? Wann soll man welche wählen?
Ich verwende derzeit einige lineare Modelle mit gemischten Effekten. Ich benutze das Paket "lme4" in R. Meine Modelle haben die Form: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Bevor ich meine Modelle ausführte, überprüfte ich die mögliche Multikollinearität zwischen Prädiktoren. Ich habe das gemacht von: …
Ich habe einen wiederholten Entwurf durchgeführt, bei dem ich 30 Männer und 30 Frauen in drei verschiedenen Aufgaben getestet habe. Ich möchte verstehen, wie unterschiedlich sich Männer und Frauen verhalten und wie das von der jeweiligen Aufgabe abhängt. Ich habe sowohl das lmer- als auch das lme4-Paket verwendet, um dies …
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