Statistiken und Big Data survival

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Was ist der Unterschied zwischen der Ausgabe von "coef" und "(exp) coef" von coxph in R?

Ich habe versucht zu erkennen, was genau die Ausgabe von "coef" und "(exp) coef" von coxph bedeutet. Es scheint, dass die "(exp) coef" Vergleiche der ersten Variablen im Modell gemäß der im Befehl zugewiesenen Gruppe sind. Wie kommt die Coxph-Funktion zu den Werten für "coef" und "(exp) coef"? Wie ermittelt …

14 r survival interpretation

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Wie können maschinelle Lernmodelle (GBM, NN usw.) für die Überlebensanalyse verwendet werden?

Ich weiß , dass traditionelle statistische Modelle wie Cox Proportional - Hazards - Regression und einige Kaplan-Meier - Modelle verwendet werden können Tage bis zum nächsten Auftreten eines Ereignisses sagt Ausfall etc. dh zur Vorhersage überleben Analyse Fragen Wie können Regressionsversionen von Modellen für maschinelles Lernen wie GBM, neuronale Netze …

13 machine-learning classification survival cox-model kaplan-meier

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Laymans Erklärung der Zensur in der Überlebensanalyse

Ich habe gelesen, was Zensur ist und wie sie in der Überlebensanalyse berücksichtigt werden muss, aber ich würde gerne eine weniger mathematische Definition und eine intuitivere Definition hören (Bilder wären toll!). Kann mir jemand eine Erklärung zu 1) Zensur und 2) Auswirkungen wie Kaplan-Meier-Kurven und Cox-Regression geben?

13 survival cox-model censoring

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Unterscheidet sich die Anpassung des Cox-Modells mit Schichten- und Schicht-Kovariaten-Interaktion von der Anpassung zweier Cox-Modelle?

In Regressionsmodellierungsstrategien von Harrell (zweite Ausgabe) wird in Abschnitt (S. 20.1.7) auf Cox-Modelle eingegangen, einschließlich einer Wechselwirkung zwischen einer Kovariate, deren Haupteffekt auf das Überleben ebenfalls geschätzt werden soll (Alter im folgenden Beispiel), und a Kovariate, deren Haupteffekt wir nicht einschätzen wollen (Geschlecht im Beispiel unten). Konkret: Nehmen wir an, …

13 survival cox-model stratification

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Interpretation und Validierung eines Cox-Regressionsmodells für proportionale Gefahren unter Verwendung von R in Klartext

Kann mir jemand mein Cox-Modell im Klartext erklären? Ich habe das folgende Cox-Regressionsmodell mithilfe der Funktion an alle meine Daten angepasst cph. Meine Daten werden in einem Objekt namens gespeichert Data. Die Variablen w, xund ysind stetig; zist ein Faktor von zwei Ebenen. Die Zeit wird in Monaten gemessen. Bei …

13 r cross-validation survival cox-model

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Wie werden die Gefährdungsquoten eines proportionalen Cox-Gefährdungsmodells in Englisch angegeben?

Meines Wissens nach vergleicht eine Hazard Ratio aus einem proportionalen Cox-Hazard-Modell die Auswirkung eines bestimmten Faktors auf die Hazard Rate mit einer Referenzgruppe. Wie würden Sie das einem Publikum melden, das keine Statistiken kennt? Versuchen wir ein Beispiel zu formulieren. Nehmen wir an, wir lassen die Leute untersuchen, wie lange …

13 survival cox-model

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Ein Regressionsmodell, dessen Antwortvariable der Tag des Jahres ist, an dem (normalerweise) ein jährliches Ereignis auftritt

In diesem speziellen Fall beziehe ich mich auf den Tag, an dem ein See gefriert. Dieses "Ice-On" -Datum tritt nur einmal im Jahr auf, aber manchmal überhaupt nicht (wenn der Winter warm ist). In einem Jahr kann der See an Tag 20 (20. Januar) einfrieren und in einem anderen Jahr …

13 regression time-series survival data-transformation recurrent-events

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So schätzen Sie die Grundlinien-Gefährdungsfunktion im Cox-Modell mit R.

Ich muss die Grundlinien-Gefährdungsfunktion in einem zeitabhängigen Cox-Modell schätzenλ0( t )λ0(t)\lambda_0(t) λ ( t ) = λ0( t ) exp( Z.( t )'β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z.(t)'β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Während ich den Überlebenskurs belegte, erinnere ich mich, dass die direkte Ableitung der kumulativen Gefahrenfunktion ( λ0( t ) dt = dΛ0( t )λ0(t)dt=dΛ0(t)\lambda_0(t) …

13 r survival cox-model

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GBM-Paket vs. Caret mit GBM

Ich habe das Modell mit optimiert caret, aber dann das Modell mit dem gbmPaket erneut ausgeführt. Nach meinem Verständnis sollten das verwendete caretPaket gbmund die Ausgabe identisch sein. Nur ein kurzer Testlauf mit data(iris)zeigt jedoch eine Diskrepanz im Modell von etwa 5% unter Verwendung von RMSE und R ^ 2 …

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Modellierung, wenn die abhängige Variable einen "Cut-Off" hat

Bitte entschuldigen Sie im Voraus, falls eine der von mir verwendeten Begriffe nicht korrekt ist. Ich würde jede Korrektur begrüßen. Wenn das, was ich als "Abschaltung" beschreibe, einen anderen Namen hat, lass es mich wissen und ich kann die Frage aktualisieren. Die Situation, die mich interessiert, ist folgende: Sie haben …

12 regression modeling survival censoring

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Wie kann man aus Gebrechlichkeitsmodellen vorhergesagte Überlebenskurven erstellen (mit R coxph)?

Ich möchte die vorhergesagte Überlebensfunktion für ein proportionales Cox-Gefährdungsmodell mit fragilen Begriffen berechnen [unter Verwendung des Überlebenspakets]. Es scheint, dass die vorhergesagte Überlebensfunktion nicht berechnet werden kann, wenn sich Gebrechlichkeitsterme im Modell befinden. ## Example require(survival) data(rats) ## Create fake weight set.seed(90989) rats$weight<-runif(nrow(rats),0.2,0.9) ## Cox model with gamma frailty on …

12 r survival cox-model frailty

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Was sind die Unterschiede zwischen Überlebensanalyse und Poisson-Regression?

Ich arbeite an einem klassischen Problem der Abwanderungsvorhersage unter Verwendung der Anzahl der Besuche eines bestimmten Benutzers auf einer Website und dachte, dass die Poisson-Regression das richtige Werkzeug ist, um das zukünftige Engagement dieses Benutzers zu modellieren. Als ich dann auf ein Buch über Überlebensanalyse und Gefahrenmodellierung stieß, wusste ich …

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Vergleichen Sie zwei Überlebenskurven für gepaarte Daten

Ich möchte zwei verschiedene Methoden zum Erkennen von Statusänderungen in einer Überlebensanalyse vergleichen. Eine Gruppe von Probanden wird über einen längeren Zeitraum (viele Jahre) beobachtet, und es wurden zwei Untersuchungsmethoden angewendet, um zu prüfen, ob eine Statusänderung stattgefunden hat. Eine Methode wurde verwendet, um jedes Subjekt zweimal im Jahr zu …

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Unterschiede zwischen PROC Mixed und lme / lmer in R - Freiheitsgraden

Hinweis: Diese Frage ist ein Repost, da meine vorherige Frage aus rechtlichen Gründen gelöscht werden musste. Beim Vergleich von PROC MIXED von SAS mit der Funktion lmeaus dem nlmePaket in R bin ich auf einige verwirrende Unterschiede gestoßen. Insbesondere unterscheiden sich die Freiheitsgrade in den verschiedenen Tests zwischen PROC MIXEDund …

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Wie kann man das mediane Überleben zwischen Gruppen vergleichen?

Ich untersuche das mediane Überleben mit Kaplan-Meier in verschiedenen Staaten für eine Krebsart. Es gibt ziemlich große Unterschiede zwischen den Staaten. Wie kann ich das mediane Überleben aller Bundesstaaten vergleichen und feststellen, welche signifikant vom mittleren medianen Überleben im ganzen Land abweichen?

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Als «survival» getaggte Fragen