Als «efficiency» getaggte Fragen

17
Gibt es einen hochwertigen nichtlinearen Programmierlöser für Python?
Ich habe mehrere herausfordernde nicht konvexe globale Optimierungsprobleme zu lösen. Derzeit verwende ich die Optimization Toolbox von MATLAB (speziell fmincon()mit algorithm = 'sqp'), was sehr effektiv ist . Der größte Teil meines Codes ist jedoch in Python, und ich würde die Optimierung gerne auch in Python durchführen. Gibt es einen …
3
Was ist der Rechenaufwand von
Eines der Hauptprobleme, mit denen wir uns in molekularen Simulationen befassen müssen, ist die Berechnung von entfernungsabhängigen Kräften. Wenn wir die Kraft- und Abstandsfunktionen einschränken können, um gerade Potenzen des Abstandes , können wir einfach das Quadrat des Abstandes r 2 = r ⋅ r berechnen und müssen uns nicht …
26 efficiency 
3
Was sind die Vor- und Nachteile der Parallelisierungsalgorithmen für die Partikelzerlegung und die Domänenzerlegung?
Ich führe Molekulardynamik (MD) -Simulationen mit verschiedenen Softwarepaketen wie Gromacs und DL_POLY durch. Gromacs unterstützt jetzt sowohl den Partikelzerlegungs- als auch den Domänenzerlegungsalgorithmus . Standardmäßig verwenden Gromacs-Simulationen die Domänenzerlegung, obwohl bis vor kurzem die Partikelzerlegung für viele Jahre die einzige in Gromacs implementierte Methode war. In einem der Gromacs-Artikel (DOI …
3
I / O-Strategien für Rechenprobleme mit großen Datenmengen?
Meine Forschungsgruppe konzentriert sich auf die Molekulardynamik, die offensichtlich als Teil einer einzelnen Flugbahn Gigabyte an Daten erzeugen kann, die dann analysiert werden müssen. Einige der Probleme, mit denen wir uns befassen, betreffen Korrelationen im Datensatz. Dies bedeutet, dass wir große Datenmengen im Speicher verfolgen und analysieren müssen, anstatt einen …
15 python  c  efficiency 
1
Suchkosten im Vergleich zu Berechnungen
Ich bin daran interessiert, Berechnungen aufzustellen, um zu prüfen, ob ein Abstandskriterium erfüllt ist: Das heißt, der Abstand zwischen einem Vektor xixi{\bf x}_i und einem anderen Vektor xjxj{\bf x}_j sollte kleiner sein als ein Wert rmaxrmaxr_{\rm max} . Meine Daten sind nach einem orthogonalen Koordinatenraster unterteilt. Da mein Grenzwert kleiner …
12 efficiency 
2
Wann ist eine automatische Differenzierung günstig?
Durch die automatische Unterscheidung können wir die Ableitung eines Programms für eine bestimmte Eingabe numerisch auswerten. Es gibt einen Satz, der besagt, dass diese Berechnung weniger als das Fünffache der Kosten für die Ausführung des ursprünglichen Programms kostet. Dieser Faktor fünf ist eine Obergrenze. In welchen Situationen können diese Kosten …
3
Gibt es eine Komplexität zwischen und [geschlossen]
Geschlossen. Diese Frage ist nicht zum Thema . Derzeit werden keine Antworten akzeptiert. Möchten Sie diese Frage verbessern? Aktualisieren Sie die Frage so dass es beim Thema für Computational Science Stapel Börse. Geschlossen vor 5 Jahren . Gibt es einen Komplexitätsgrad, der größer als und kleiner als ?O ( n …
3
Nvidia K20X gegen GeForce Titan für GPGPU-Beschleunigung
Ich versuche den Unterschied zwischen diesen beiden Grafikkarten für das akademische Rechnen zu verstehen, speziell für die DGEMM-Komponente. Wenn wir uns die Rohstatistik ansehen, haben beide den gleichen GK110-Chip, vergleichbare Statistiken in praktisch jeder Kategorie und, glaube ich, die gleiche Kernarchitektur. Vor jeglichen Rabatten ist der K20X ungefähr viermal so …
Durch die Nutzung unserer Website bestätigen Sie, dass Sie unsere Cookie-Richtlinie und Datenschutzrichtlinie gelesen und verstanden haben.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.