Als «r» getaggte Fragen

Verwenden Sie dieses Tag für jede * themenbezogene * Frage, bei der (a) "R" entweder als kritischer Teil der Frage oder als erwartete Antwort enthält, und (b) nicht * nur * die Verwendung von "R" betrifft.


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Berechnen Sie die Übergangsmatrix (Markov) in R
Gibt es in R (eine eingebaute Funktion) eine Möglichkeit, die Übergangsmatrix für eine Markov-Kette aus einer Reihe von Beobachtungen zu berechnen? Nehmen Sie zum Beispiel einen Datensatz wie den folgenden und berechnen Sie die Übergangsmatrix erster Ordnung? dat<-data.frame(replicate(20,sample(c("A", "B", "C","D"), size = 100, replace=TRUE)))
29 r  markov-process 

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Anpassen eines ARIMAX-Modells mit Regularisierung oder Bestrafung (z. B. mit Lasso, elastischem Netz oder Kammregression)
Ich verwende die auto.arima () -Funktion im Vorhersagepaket , um ARMAX-Modelle mit einer Vielzahl von Kovariaten zu kombinieren. Ich habe jedoch oft eine große Anzahl von Variablen zur Auswahl und erhalte normalerweise ein endgültiges Modell, das mit einer Teilmenge von ihnen funktioniert. Ich mag keine Ad-hoc-Techniken für die Variablenauswahl, weil …

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Wie führt man eine orthogonale Regression (kleinste Quadrate) über PCA durch?
Ich benutze immer lm()in R, um eine lineare Regression von auf durchzuführen . Diese Funktion gibt einen Koeffizienten so dassyyyxxxββ\betay=βx.y=βx.y = \beta x. Heute habe ich etwas über die kleinsten Fehlerquadrate gelernt und diese princomp()Funktion (Hauptkomponentenanalyse, PCA) kann verwendet werden, um sie auszuführen. Es sollte gut für mich sein (genauer). …


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R: Zufällige Gesamtstruktur, die NaN / Inf im Fehler "fremder Funktionsaufruf" trotz fehlender NaNs im Datensatz auslöst [geschlossen]
Ich verwende Caret, um eine kreuzvalidierte zufällige Gesamtstruktur über ein Dataset auszuführen. Die Y-Variable ist ein Faktor. In meinem Datensatz befinden sich keine NaNs, Infs oder NAs. Allerdings bekomme ich, wenn ich den zufälligen Wald laufen lasse Error in randomForest.default(m, y, ...) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1) …




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Vergleich hierarchischer Cluster-Dendrogramme, die mit unterschiedlichen Entfernungen und Methoden erhalten wurden
[Der ursprüngliche Titel "Ähnlichkeitsmessung für hierarchische Clusterbäume" wurde später von @ttnphns geändert, um das Thema besser widerzuspiegeln.] Ich führe eine Reihe von hierarchischen Clusteranalysen für einen Datenrahmen von Patientenakten durch (z. B. ähnlich wie http://www.biomedcentral.com/1471-2105/5/126/figure/F1?highres=y ). Ich experimentiere mit verschiedenen Distanzmaßen , verschiedenen Parametergewichten und verschiedenen hierarchischen Methoden , um …

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Wie erhält man einen "gesamten" p-Wert und eine Effektgröße für einen kategorialen Faktor in einem gemischten Modell (lme4)?
Ich möchte einen p-Wert und eine Effektgröße einer unabhängigen kategorialen Variablen (mit mehreren Ebenen) erhalten - das ist "insgesamt" und nicht für jede Ebene separat, wie es die normale Ausgabe von lme4in R ist. Es ist genau wie das, was die Leute berichten, wenn sie eine ANOVA betreiben. Wie kann …

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Warum und wann ein R-Paket erstellen?
Ich verstehe, dass diese Frage recht weit gefasst ist, aber ich frage mich, was die entscheidenden Punkte für die Entscheidung sein sollten, ein neues Paket für R zu erstellen (oder nicht). Um genauer zu sein, möchte ich hinzufügen, dass es bei der Frage nicht um die Gründe geht Verwenden Sie …
28 r  software 


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Pseudo-R-Quadrat-Formel für GLMs
Eine Formel für Pseudo fand ich in dem Buch Extending the Linear Model with R., Julian J. Faraway (S. 59).R2R2R^2 1−ResidualDevianceNullDeviance1−ResidualDevianceNullDeviance1-\frac{\text{ResidualDeviance}}{\text{NullDeviance}} . Ist dies eine gebräuchliche Formel für Pseudo für GLMs?R2R2R^2

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Welche Gefahren birgt die Verletzung der Homoskedastizitätsannahme für die lineare Regression?
Betrachten Sie als Beispiel den ChickWeightDatensatz in R. Die Varianz wächst offensichtlich mit der Zeit. Wenn ich also eine einfache lineare Regression verwende, wie: m <- lm(weight ~ Time*Diet, data=ChickWeight) Meine Fragen: Welche Aspekte des Modells werden fraglich sein? Beschränken sich die Probleme darauf, außerhalb des TimeBereichs zu extrapolieren ? …

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