Gemischte (auch als mehrstufige oder hierarchische) Modelle sind lineare Modelle, die sowohl feste als auch zufällige Effekte enthalten. Sie werden verwendet, um longitudinale oder verschachtelte Daten zu modellieren.
Effectspackage bietet eine sehr schnelle und bequeme Möglichkeit , lineare Mischeffekt-Modellergebnisse zu zeichnen, die mit lme4package erhalten wurden . Die effectFunktion berechnet Konfidenzintervalle (CIs) sehr schnell, aber wie vertrauenswürdig sind diese Konfidenzintervalle? Beispielsweise: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength ~ batch + (1 | cask), Pastes) effs <- as.data.frame(effect(c("batch"), …
Unter welchen Bedingungen sollte jemand in Betracht ziehen, eine mehrstufige / hierarchische Analyse anstelle einer grundlegenderen / traditionelleren Analyse (z. B. ANOVA, OLS-Regression usw.) zu verwenden? Gibt es Situationen, in denen dies als obligatorisch angesehen werden könnte? Gibt es Situationen, in denen die Verwendung einer mehrstufigen / hierarchischen Analyse ungeeignet …
Kürzlich wurde mir klar, dass ein gemischtes Modell mit nur einem Subjekt als Zufallsfaktor und den anderen Faktoren als festen Faktoren einer ANOVA entspricht, wenn die Korrelationsstruktur des gemischten Modells auf zusammengesetzte Symmetrie eingestellt wird. Daher möchte ich wissen, was Verbindungssymmetrie im Kontext einer gemischten (dh aufgeteilten) ANOVA bedeutet, bestenfalls …
Ich habe Daten aus einem Experiment gesammelt, das wie folgt organisiert ist: Zwei Standorte mit jeweils 30 Bäumen. 15 werden behandelt, 15 werden an jeder Stelle kontrolliert. Von jedem Baum nehmen wir drei Stängelstücke und drei Wurzelstücke, also 6 Proben der Stufe 1 pro Baum, die durch eine von zwei …
Ich versuche zu verstehen, wann ein zufälliger Effekt verwendet werden soll und wann er nicht erforderlich ist. Ich habe eine Faustregel erhalten, wenn Sie 4 oder mehr Gruppen / Individuen haben, die ich tue (15 einzelne Elche). Einige dieser Elche wurden zwei- oder dreimal für insgesamt 29 Versuche experimentiert. Ich …
Ich frage mich, was die Unterschiede zwischen gemischten und ungemischten GLMs sind. In SPSS können Benutzer beispielsweise über das Dropdown-Menü Folgendes anpassen: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Gehen sie anders mit fehlenden Werten um? Meine abhängige Variable ist binär und ich habe …
Sehr geehrte Damen und Herren, mir ist etwas Merkwürdiges aufgefallen, das ich Ihnen nicht erklären kann. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass der manuelle Ansatz zur Berechnung eines Konfidenzintervalls in einem logistischen Regressionsmodell und die R-Funktion confint()unterschiedliche Ergebnisse liefern. Ich habe die angewandte logistische Regression von Hosmer & Lemeshow (2. Auflage) …
Ich habe ein gemischtes Effektmodell (in der Tat ein verallgemeinertes additives gemischtes Modell), das mir Vorhersagen für eine Zeitreihe gibt. Um der Autokorrelation entgegenzuwirken, verwende ich ein corCAR1-Modell, da mir Daten fehlen. Die Daten sollen mir eine Gesamtlast geben, daher muss ich über das gesamte Vorhersageintervall summieren. Aber ich sollte …
Ich möchte ein mehrstufiges GLMM mit einer Poisson-Verteilung (mit Überdispersion) unter Verwendung von R ausrüsten. Im Moment verwende ich lme4, aber mir ist aufgefallen, dass die quasipoissonFamilie kürzlich entfernt wurde. Ich habe an anderer Stelle gesehen, dass Sie additive Überdispersion für Binomialverteilungen modellieren können, indem Sie einen zufälligen Achsenabschnitt mit …
Ich versuche, einige Daten mit einem gemischten Effektmodell zu analysieren. Die von mir gesammelten Daten repräsentieren das Gewicht einiger Jungtiere unterschiedlichen Genotyps im Zeitverlauf. Ich verwende den hier vorgeschlagenen Ansatz: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ Insbesondere verwende ich Lösung # 2 Also ich habe sowas require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, random …
Hoffentlich ist dies eine Frage, die mir hier jemand zur Art der Zerlegung von Quadratsummen aus einem Modell mit gemischten Effekten beantworten kann, das dazu passt lmer(aus dem Paket lme4 R). Zuallererst sollte ich sagen, dass mir die Kontroverse bei der Verwendung dieses Ansatzes bewusst ist, und in der Praxis …
Ich habe mich gefragt, ob mich jemand über die aktuellen Unterschiede zwischen diesen beiden Funktionen aufklären könnte. Ich fand die folgende Frage: Wie wähle ich die Bibliothek nlme oder lme4 R für Modelle mit gemischten Effekten? , aber das stammt aus ein paar Jahren. Das ist ein Leben lang in …
Ich möchte einen p-Wert und eine Effektgröße einer unabhängigen kategorialen Variablen (mit mehreren Ebenen) erhalten - das ist "insgesamt" und nicht für jede Ebene separat, wie es die normale Ausgabe von lme4in R ist. Es ist genau wie das, was die Leute berichten, wenn sie eine ANOVA betreiben. Wie kann …
Ich hoffe, diese Frage stört Sie alle nicht, aber ich brauche Hilfe bei der Interpretation der Ausgabe für ein lineares Mischeffektmodell, das ich in R lernen wollte. Ich bin neu in der Längsschnittdatenanalyse und der linearen Mischeffektregression. Ich habe ein Modell, das ich mit Wochen als Zeitprädiktor ausstattete, und als …
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