Ich habe einen Spline erstellt, um meine Daten in Python anzupassen, indem ich: spline=scipy.interpolate.UnivariateSpline(energy, fpp, k=4) Die Gleichung, die ich verwenden möchte, beinhaltet eine Summation zwischen n = 2 und n = unendlich, wobei n die Ordnung des Differentials an einem Punkt Eo ist. Verwenden Sie jedoch; UnivariateSpline.__call__(spline, e0, nu=n) …
Ich möchte den Einfluss von Solvatationsparametern in impliziten Solvatationsmodellen testen und mich fragen, welche Codes als eigenständige Programme für die Proteinfaltung kleiner Proteine frei verfügbar sind und welche Energieminimierungsansätze anstelle von Dynamik verwenden. Daher suche ich nicht nach molekulardynamischen Codes .
Ich weiß, dass ich eine Toleranz für den Vergleich von Gleitkommazahlen verwenden sollte. Aber zum Vergleichen von Vektoren kann ich mir 3 mögliche Lösungen vorstellen, die unterschiedlichen Abstandsmetriken entsprechen: Vergleichen Sie die Komponenten jedes Vektors einzeln: Die Vektoren sind gleich, wenn alle 3 innerhalb der Toleranz liegen. Diese Option würde …
Normalerweise verwende ich den Aufruf, wenn ich einen sequentiellen Zufallszahlengenerator in C setze srand(time(NULL)) dann benutze rand() mod N um eine zufällige ganze Zahl zwischen 0 und N-1 zu erhalten. Wenn ich dies jedoch parallel mache, sind die Aufrufe zur Zeit (NULL) so nahe beieinander, dass sie genau dieselbe Nummer …
Ich stelle die Leistung der linearen Löser von PETSc vor. So wie ich es verstehe, speedup=Sequential TimeParallel Time.speedup=Sequential TimeParallel Time.\text{speedup}=\frac{\text{Sequential Time}}{\text{Parallel Time}}. Ich weiß, dass das Ausführen des parallelen Codes auf einem Prozessor als Proxy für die sequentielle Leistung verwendet werden kann. Ich denke jedoch nicht, dass dies aufgrund des …
Ich versuche, ein einseitiges nichtlineares Problem der kleinsten Quadrate mit linearen Einschränkungen zu lösen, dh das Problem: minx∑mi=1ri(x) s.t Ax≤bminx∑i=1mri(x) s.t Ax≤b\min_{\mathbf{x}} \quad \sum^m_{i=1} \mathbf{r}_i(\mathbf{x}) \qquad \text{ s.t } \quad A\mathbf{x} \leq \mathbf{b} wo ri(x)=fi(x)2ri(x)=fi(x)2r_i(\mathbf{x})=f_i(\mathbf{x})^2 wenn fi(x)>0fi(x)>0f_i(\mathbf{x})>0 und ri(x)=0ri(x)=0r_i(\mathbf{x})=0 sonst. Mit anderen Worten, dies kann als Problem der kleinsten Quadrate …
Ich möchte künstliche neuronale Netze (ANN) verwenden, um die Reaktionsgeschwindigkeiten in meiner Flüssigkeit vorherzusagen, anstatt das gesamte System steifer ODEs zu lösen. Einige Leute aus meinem Labor haben bereits daran gearbeitet, damit ich nicht bei Null anfange, sondern Probleme mit meinen Anwendungen habe. Eine davon bezieht sich meiner Meinung nach …
Ich habe diese Antwort gelesen und festgestellt, dass ich den Unterschied zwischen aufeinanderfolgenden Iterationen verwendet habe, um ein Stoppkriterium für eine iterative Methode zum Finden von Eigenwerten / Vektoren zu definieren. Was sind gute Stoppkriterien für iterative Methoden, die zu Eigenwerten und Eigenvektoren konvergieren?
Ich habe eine Reihe von Dateien, die aus zufällig ausgewählten Punkten aus einem Datensatz bestehen, wobei jede Datei zu einer bestimmten Klasse gehört. Jede Zeile in diesen Dateien enthält die Koordinaten im n-Raum des Punktes. Ich möchte die Verteilungen im n-Raum jeder dieser Dateien vergleichen - und bin vom KS-Test …
Ich erinnere mich schwach an meine frühen "numerischen" Vorlesungen, dass iterative lineare Löser für oft erfordern, wenn zerlegt wird alsAx=bEINx=bAx=bAEINA A=D+MEIN=D.+M.A=D + M Wenn D eine Diagonalmatrix ist und eine Diagonale von Null hat, sollten die Elemente von über den Einträgen in dominieren, damit iterative Löser eine gute Leistung erbringen.MM.MDD.DMM.M …
Welche numerischen Methoden stehen zur Verfügung, um den Fixpunkt eines Operators , der auf die Funktionen einwirkt ? Ich suche die Funktion für die .f : [ a , b ] → [ a , b ] f A f = fEINEINAf: [ a , b ] → [ a …
Ich möchte mit Objective-C mit der wissenschaftlichen Programmierung auf dem Mac beginnen. Ich bin mit MATLAB sehr vertraut, da es einfach ist, Wellenformdaten mit komplexen Werten in Vektoren zu speichern und Diagramme zu erstellen. Ich habe mich gefragt, ob es möglicherweise eine gute Ressource gibt, mit der Sie vergleichen können, …
Manchmal ist es in meiner Arbeit nützlich, den Open-Source-Code eines anderen zu ändern oder herauszufinden, wie Sie bestimmte Dinge für Ihre eigene Anwendung entwickeln können. Allerdings verfügen nicht alle Softwareprogramme über eine gute Dokumentation. Was ist ein guter Weg, um die Gesamtstruktur einer Codebasis zu verstehen? Welche Routinen rufen beispielsweise …
Meine Frage wird wahrscheinlich zu allgemein sein, um sie mit ein paar Worten zu beantworten. Könnten Sie bitte in diesem Fall eine gute Lektüre vorschlagen? Projektionsmethoden werden verwendet, um die Größe des Lösungsraums für die Probleme zu reduzieren. Und es gibt mindestens zwei sehr interessante Anwendungen (aus meiner Sicht). Das …
Ich löse ein System mit Singularwertzerlegung. Die Singularwerte (vor der Skalierung) sind: 1.82277e+29 1.95011e+27 1.15033e+23 1.45291e+21 4.79336e+17 7.48116e+15 8.31087e+12 1.71838e+11 5.63232e+08 2.17863e+08 9.02783e+07 1.72345e+07 1.73889e+05 8.09382e+02 2.16644e+00 Ich habe festgestellt, dass das Akzeptieren aller Singularwerte und des damit verbundenen Beitrags zu meinem Lösungsvektor zu schlechten Ergebnissen führt. Ich skaliere sie …
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