Programmierung rcpp

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Beschleunigen Sie den Schleifenbetrieb in R.

Ich habe ein großes Leistungsproblem in R. Ich habe eine Funktion geschrieben, die über ein data.frameObjekt iteriert . Es fügt einfach eine neue Spalte zu a hinzu data.frameund sammelt etwas an. (einfache Bedienung). Der data.framehat ungefähr 850K Zeilen. Mein PC funktioniert noch (ungefähr 10 Stunden) und ich habe keine Ahnung …

193 performance r loops rcpp r-faq

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Wo kann ich lernen, wie man C-Code schreibt, um langsame R-Funktionen zu beschleunigen? [geschlossen]

Geschlossen. Diese Frage entspricht nicht den Richtlinien für Stapelüberlauf . Derzeit werden keine Antworten akzeptiert. Möchten Sie diese Frage verbessern? Aktualisieren Sie die Frage so dass es beim Thema für Stack - Überlauf. Geschlossen vor 3 Jahren . Verbessere diese Frage Was ist die beste Ressource, um zu lernen, wie …

115 r rcpp

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R install.packages gibt "Sperrverzeichnis konnte nicht erstellt werden" zurück.

Beim Herunterladen des Rcpp-Pakets wird folgende Fehlermeldung angezeigt: > install.packages("Rcpp", dependencies=TRUE) Installing package(s) into ‘/home/me/src/Rlibs’ (as ‘lib’ is unspecified) trying URL 'http://cran.us.r-project.org/src/contrib/Rcpp_0.10.2.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 2380089 bytes (2.3 Mb) ... Warning in dir.create(lockdir, recursive = TRUE) : cannot create dir '/home', reason 'Permission denied' ERROR: failed to create lock …

73 r package rcpp

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Optimierung der R-Zielfunktion mit Rcpp langsamer, warum?

Ich arbeite derzeit an einer Bayes'schen Methode, die mehrere Schritte zur Optimierung eines multinomialen Logit-Modells pro Iteration erfordert. Ich verwende optim (), um diese Optimierungen durchzuführen, und eine in R geschriebene Zielfunktion. Eine Profilerstellung ergab, dass optim () der Hauptengpass ist. Nachdem ich mich umgesehen hatte, fand ich diese Frage, …

16 c++ r optimization rcpp

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RcppArmadillos sample () ist nach der Aktualisierung von R nicht eindeutig

Ich arbeite üblicherweise mit einer kurzen Rcpp-Funktion, die als Eingabe eine Matrix verwendet, in der jede Zeile K Wahrscheinlichkeiten enthält, die sich zu 1 summieren. Die Funktion tastet dann für jede Zeile zufällig eine Ganzzahl zwischen 1 und K ab, die den bereitgestellten Wahrscheinlichkeiten entspricht. Dies ist die Funktion: // …

9 r rcpp rcpparmadillo

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Richtige Methode, um einen Zeiger von einer Rcpp-Funktion auf ein "neues" Objekt zurückzugeben

Betrachten Sie 1) eine benutzerdefinierte Klasse mit einem potenziell großen Speicherdruck und 2) eine Funktion der obersten Ebene, die eine Vorverarbeitung durchführt und dann ein neues Objekt unserer benutzerdefinierten Klasse erstellt und zurückgibt. Um unnötiges Kopieren nach Wert zu vermeiden, weist die Funktion das Objekt zu und gibt stattdessen einen …

9 c++ r rcpp

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Rcpp- und int64-NA-Wert

Wie kann ich einen NA-Wert von Rcpp an R in einem 64-Bit-Vektor übergeben? Mein erster Ansatz wäre: // [[Rcpp::export]] Rcpp::NumericVector foo() { Rcpp::NumericVector res(2); int64_t val = 1234567890123456789; std::memcpy(&(res[0]), &(val), sizeof(double)); res[1] = NA_REAL; res.attr("class") = "integer64"; return res; } Aber es gibt nach #> foo() integer64 [1] 1234567890123456789 9218868437227407266 …

8 r rcpp na bit64

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Sortieren benannter numerischer Vektoren in Rcpp

In einer Funktion möchte ich numerische Werte berechnen, ihnen Namen geben und eine NumericVectorin Rcpp sortierte zurückgeben. Ich kann die Vektoren sortieren ( damit ), aber die Reihenfolge der Namen der Werte bleibt gleich. library(Rcpp) x <- c(a = 1, b = 5, c = 3) cppFunction(' NumericVector foo(NumericVector x) …

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Als «rcpp» getaggte Fragen