Unix & Linux awk

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Entfernen von Zeilen mit NA in jeder Spalte

Ich habe eine durch Tabulatoren getrennte Datei, die folgendermaßen aussieht: gene v1 v2 v3 v4 g1 NA NA NA NA g2 NA NA 2 3 g3 NA NA NA NA g4 1 2 3 2 Die Anzahl der Felder in jeder Zeile ist fest und gleich. Ich möchte diese Zeilen …

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Ersetzen übereinstimmender Einträge in einer Spalte einer Datei durch eine andere Spalte aus einer anderen Datei

Ich habe zwei durch Tabulatoren getrennte Dateien, die wie folgt aussehen: Datei1: NC_008146.1 WP_011558474.1 1155234 1156286 44173 NC_008146.1 WP_011558475.1 1156298 1156807 12 NC_008146.1 WP_011558476.1 1156804 1157820 -3 NC_008705.1 WP_011558474.1 1159543 1160595 42748 NC_008705.1 WP_011558475.1 1160607 1161116 12 NC_008705.1 WP_011558476.1 1161113 1162129 -3 NC_009077.1 WP_011559727.1 2481079 2481633 8 NC_009077.1 WP_011854835.1 1163068 …

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Manipulieren Sie das wissenschaftliche Format ohne das "e"

Ich versuche, eine Datei zu manipulieren, die Zahlen in wissenschaftlicher Notation enthält, aber ohne das eSymbol, dh 1.2e+3geschrieben als 1.2+3. Die einfachste Sache , die ich dachte , mit zu tun , awkwar zu ersetzen +mit e+, die unter Verwendung von gsubFunktion und meine Berechnung in der neuen Datei zu …

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Referenzieren von Array-Elementen durch Zeichenfolgen und Initialisieren von Arrays in awk

#!/usr/bin/env bash awk ' BEGIN { arr[A]=1; arr[B]=1; arr[C]=1; arr[E]=1; arr[J]=8; arr[Q]=10; print arr[J] }' Der obige Befehl gibt den zuletzt eingestellten Wert für aus arr['subscript']. In diesem Fall 10ist dies der Wert von arr[Q]kurz zuvor printund nicht 8der Wert von arr[J]. Wie im obigen Skript möchte ich auch nicht …

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Löschen eines Teils einer Textdatei und folgender Zeilen mit sed

Ich muss eine Datei wie folgt bearbeiten: auto wlx00 allow-hotplug wlx00 iface wlx000 inet dhcp iface wlx000 inet6 auto post-up sysctl -w net.ipv6.conf.wlx000.accept_ra=2 auto wlx000 Das Ziel ist es, die Zeilen zu löschen, die mit 'iface ... inet6' beginnen, und auch die nächsten Zeilen zu löschen, die mit Leerzeichen beginnen …

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Durch Leerzeichen begrenzen, aber Backslash-Leerzeichen ignorieren

5678 [] testing,\ group [] [testing [] ip\ 5.6.7.8 [] launch-wizard-1 0.0.0.0/0 456dlkjfa [] 1.2.3.4 [] test 1.2.3.4/32 4.3.2.0/23 4.3.2.0/23 default 4.3.2.0/23 4.3.2.0/23 launch-wizard-2 0.0.0.0/0 launch-wizard-3 0.0.0.0/0 2.3.4.5/32 [] Ich möchte die erste Spalte der obigen Spalte erhalten, aber der Haken ist, dass ich \ (Backslash Space) als Teil der …

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Wie kann ich die Zeilen zweier Dateien zusammenführen, indem ich gemeinsame Header habe?

Ich möchte zwei Dateien basierend auf den darin enthaltenen gemeinsamen Daten als Header zusammenführen. Es folgt das Beispiel Datei1 >Feature scaffold1 1 100 g 101 200 g 201 300 g >Feature scaffold2 1 100 g 01 500 g >Feature scaffold3 10 500 g >Feature scaffold4 10 300 g Datei 2 …

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Hinzufügen einer Zeichenfolge zu einer TXT-Datei in allen Zeilen mit Ausnahme weniger Zeichen mit sed oder awk

Ich habe eine Textdatei mit dem Namen xid.txt: xid: SC48028 id: artf398444 xid: indv1000 id: indv24519 xid: SC32173 id: artf398402 xid: SC21033 id: artf398372 xid: 1001 id: tracker4868 xid: wiki1000 id: wiki10709 xid: proj1234 id: proj12556 Ich muss eine Zeichenfolge 'PT_' vor 'SC48028', 'SC32173' usw. hinzufügen. Die Zeichenfolge 'SC ...' …

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Optionales Funktionsargument erkennen (skalar)

Betrachten Sie dieses Skript: function alfa(bravo, charlie) { if (charlie) return "charlie good" else { return "charlie bad" } } BEGIN { print alfa(1, 1) print alfa(1, 0) print alfa(1, "") print alfa(1) } Ergebnis: charlie good charlie bad charlie bad charlie bad Kann Awk feststellen, wenn kein Argument vorgebracht …

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Wie drucke ich die erste Spalte der nächsten Zeile in der aktuellen Zeile?

Ich habe eine Datei wie diese: abc 123 abc 789 bcd 456 acb 135 Ich möchte die erste Spalte der nächsten Zeile in der aktuellen Zeile drucken. Gewünschte Ausgabe: abc 123 abc abc 789 bcd bcd 456 acb acb 135 Ich benutze lieber awk.

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Ersetzen Sie alle Werte in einer Spalte durch 1

Ich habe mehrere Textdateien mit 12 Zeilen und 3 Spalten. Beispiel: 2 6 0.74 42 6 0.58 80 6 0 112 6 0.24 132 6 1 216 6 0.7 342 6 0 390 6 0.21 432 6 0.56 466 6 0.75 524 6 0.6 646 6 0.9 Ich möchte alle …

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Trap Strg-C in awk-Skript

Ich glaube Ctrl- Ckann in Bash-Skripten gefangen sein. Ist es auch möglich, es in einem Awk-Skript abzufangen, um dieses Ereignis zu behandeln? Zum Beispiel, um die Verarbeitung abzubrechen, aber die Ergebnisse dessen zu drucken, was bereits verarbeitet wurde, anstatt nur stillschweigend zu beenden?

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Programmierbares Erkennen des Awk-Geschmacks (z. B. Gawk vs Nawk)

Ich verwende eine Befehlszeilenanwendung, die im Wesentlichen eine Sammlung von Bash-Shell-Skripten ist. Die Anwendung wurde für die Ausführung unter BSD / OSX und auch unter Linux geschrieben. Eines der Skripte basiert auf awk. Es enthält zwei awk-Befehle: einen für nawk (die Standard-BSD-awk-Implementierung) und einen für gawk (die GNU-awk-Implementierung). Die beiden …

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Aufteilen der Datei für jeweils 10000 Zahlen (keine Zeilen)

Ich habe eine Datei, die wie folgt aussieht: chr19 61336212 + 0 0 CG CGT chr19 61336213 - 0 0 CG CGG chr19 61336218 + 0 0 CG CGG chr19 61336219 - 0 0 CG CGC chr19 61336268 + 0 0 CG CGG chr19 61336269 - 0 0 CG CGA …

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awk endet nicht

Ich habe den folgenden Code in einer Datei mit dem Namen awktest1.awk: #!/bin/awk -f BEGIN{print "start"} {print $2, "\t", $5} END{print "end"} employee.txt wo employee.txtenthält die folgenden Daten: 100 Thomas Manager Sales $5,000 200 Jason Developer Technology $5,500 300 Sanjay Sysadmin Technology $7,000 400 Nisha Manager Marketing $9,500 500 Randy …

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Als «awk» getaggte Fragen