Nichtparametrische Bayes'sche Analyse in R

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Ich bin auf der Suche nach einem guten Tutorial zum Clustering von Daten Rmithilfe des hierarchischen Dirichlet-Prozesses (HDP) (eine der neuesten und beliebtesten nichtparametrischen Bayes-Methoden).

Für die nichtparametrische Bayes'sche Analyse gibt es DPpackage(IMHO, die umfassendste aller verfügbaren) R. Aber ich kann die Beispiele im R Newsoder im Referenzhandbuch der Verpackung nicht gut genug verstehen , um HDP zu codieren.

Jede Hilfe oder Hinweis ist willkommen.

Eine C ++ - Implementierung von HDP für die Themenmodellierung finden Sie hier (C ++ - Code finden Sie unten).

r bayesian clustering nonparametric

— suncoolsu
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Hier sind einige Online-Ressourcen, die ich interessant fand, ohne ins Detail zu gehen (und ich bin kein Spezialist für dieses Thema):

Hierarchical Dirichlet Processes von Teh et al. (2005)
Dirichlet-Prozesse Eine sanfte Anleitung von El-Arini (2008)
Bayesian Nonparametrics , von Rosasco (2010)
Nichtparametrische Bayes'sche Methoden , von Ghahramani (2005)

Die endgültige Referenz scheint zu sein

Herausgeber sind N. Hjort, C. Holmes, P. Müller und S. Walker. Bayesian Nonparametrics . Nummer 28 in der Cambridge-Reihe für statistische und probabilistische Mathematik. Cambridge University Press, 2010.

In Bezug auf R scheint es einige andere Pakete zu geben, die es wert sind, untersucht zu werden, wenn das DP-Paket nicht Ihren Anforderungen entspricht, z. B. dpmixsim , BHC oder mbsc, die auf Rseek.org zu finden sind .

— chl
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Vielen Dank. Eigentlich brauchte ich nur Zeiger für das R-Paket. Ich bedanke mich für Ihre Hilfsbereitschaft! Das Buch ist übrigens großartig.

— Suncoolsu

Allerdings werde ich warten , dass jemand mich zu einem R - Paket zu zeigen oder das zeigt , Tutorial , wie HDP basierte Modellierung in R. zu tun

— suncoolsu

@suncoolsu Ich habe diese Pakete nie ausprobiert. Mein Beitrag ist also nur ein bisschen googeln (weil ich an HDP in der Zukunft interessiert bin, aber momentan keine Zeit habe - das ist der Grund, warum ich meine Antwort CW gemacht habe). Ich vermute, dass jemand, der an diese Methoden gewöhnt ist, aufschlussreiche Bemerkungen liefert.

— Chl

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Diese beiden Links bieten einige R- (und C-) Codebeispiele für die Implementierung einer normalen DP-Mischung:

Ich habe eine andere Referenz gefunden. Kapitel 15 enthält den DP-Winbugs-Code:

http://www.ics.uci.edu/~wjohnson/BIDA/BIDABook.html

— Tal
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