Ideen für „Lab Notebook“ -Software?


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Das ist also eine seltsame Passform, obwohl ich wirklich denke, dass es für jede Site eine seltsame Passform ist. Deshalb dachte ich, ich würde es hier unter meinen datenverdächtigen Brüdern versuchen.

Ich bin aus der Biologie in die Epidemiologie und Biostatistik gekommen und habe immer noch Gewohnheiten aus diesem Bereich. Einer von ihnen führt ein Laborheft. Es ist nützlich, um Gedanken, Entscheidungen, Überlegungen zur Analyse usw. zu dokumentieren. Alles an einem Ort, alles festgeschrieben, damit ich später auf die Analyse zurückblicken und eine Ahnung haben kann, was ich getan habe.

Aber es wäre schön, das ins 21. Jahrhundert zu verschieben. Insbesondere, weil das Labornotizbuchsystem zwar für eine Person geeignet ist und Entscheidungen dokumentiert, es aber schön wäre, Zeichnungen von EDA, E-Mails von Datenmanagern, die einen bestimmten Datensatz besprechen, usw. anhängen zu können.

Ich vermute, dass dies das Aufrüsten meines eigenen Systems aus einer unheiligen Vereinigung vieler verschiedener Teile mit sich bringen wird. Verwendet jedoch derzeit jemand ein System und hat irgendwelche Empfehlungen?


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Ich denke, es ist in Ordnung, diesen Thread für den Großvater (dh offen zu lassen).
gung - Wiedereinsetzung von Monica

Antworten:


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Diese werden als Electronic Lab Notebooks (ELN) bezeichnet.

Hier sind einige der Open Source-Optionen, die ich mir angesehen habe:

  1. Das weise Notizbuch .

  2. Das neue IPython-Notizbuch , das jetzt als Webanwendung auf EC2 und Azure ausgeführt werden kann.

  3. Leo, das mit IPython und auf viele andere Arten verwendet werden kann.

  4. Verschiedene Wiki, Blogging und CMS-Lösungen.


Am Ende habe ich ein kostenloses Wikispaces-Wiki als Ersatz für mein aktuelles experimentelles Labornotizbuch verwendet.
Fomite

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Mein Favorit: Evernote . Sie können Einträge mit Tags versehen (z. B. "Analyse", "Idee" usw.), Bilder und Grafiken einfügen und Notizbücher für Mitarbeiter freigeben. Und: es ist grundsätzlich kostenlos (na ja, Freemium). Aber die kostenlose Ausgabe ist für mich absolut ausreichend.


Darüber hinaus gibt es kostenlose Apps für Android und iOS.
Jose Zubcoff

+1 Ich finde die mobile App für Evernote besonders nützlich, wenn ich zwischen den Labors herumlaufe oder einen Gedanken niederschreibe, wenn ich nicht am Computer bin.
Jthetzel

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Ich habe es noch nie persönlich verwendet, aber Microsoft hat eine Software in der Office-Suite namens OneNote, die ein ähnliches Ziel wie Ihre E-Lab-Notebook-Spezifikationen erreicht. Weitere Informationen finden Sie auf ihrer Website . Sie bieten auch eine kostenlose Testversion mit MS Office hier gebündelt .


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@mbq hast du einen anständigen Linux-Ersatz für Onenote gefunden?
Andreas-h

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Ich fand Xmind nützlich. Sie können alles anhängen, und die Baumstruktur ist sehr nützlich für die Organisation. Mir gefällt besonders die Funktion, mit der Sie einen Drilldown in den Knoten (Thema) durchführen können. Es gibt mehr ähnliche Softwareprodukte, die das gleiche Konzept nutzen.


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Freeplane und Freemind sind zwei kostenlose Alternativen, die ich für verschiedene Projekte verwendet habe. Ein neuer Zweig von FreeMind ist SciPlore MindMappings, der die Unterstützung von BibTeX-Referenzen und das Importieren von Lesezeichen aus einer PDF-Datei umfasst.
Wayne

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Ich persönlich habe festgestellt, dass der Livescribe -Smartpen von Gott gesandt wurde.

Es vereint den vertrauenswürdigen Charme der alten Welt eines traditionellen Notizbuchs aus Stift und Papier, bietet jedoch auch die Möglichkeit, Ton aufzuzeichnen (der mit Ihren Stiftstrichen synchronisiert wird) und für eine spätere Überarbeitung vorzubereiten. NB - es gibt einen Nachteil, und das heißt, Sie müssen Spezialpapier kaufen, das mit dem Stift funktioniert

Der Audio / Stift kann ins Internet hochgeladen und dann an viele andere Programme angehängt werden, die bereits oben erwähnt wurden.

Studierende, die ich unterrichte (Biomechanik), lieben dies sehr und finden es später viel einfacher als zuvor, schwierige Konzepte zu studieren (Pre-Livescribe)


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Vielleicht möchten Sie die neueste Betaversion von Zotero testen , die jetzt eigenständig ist und Firefox nicht benötigt.


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Zotero ist ein Bibliographiemanager, kein ELN.
nico

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@nico: Ich glaube, Sie können in Zotero alles speichern, was Sie wollen, einschließlich Ihrer eigenen Dokumente. Es ist nicht gerade ein ELN, aber es ist kostenlos und würde es einfach machen, auch andere Materialien einzubeziehen (und zu indexieren).
Wayne

Sicher, und es ist großartig, dass Sie es erwähnt haben (ich benutze es oft und es ist erstaunlich), aber es gibt auch andere Open-Source-Alternativen, die speziell für ELN gedacht sind. Warum also nicht diese verwenden?
Nico

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In diesem Artikel, Verschönern von Daten in der realen Welt , von Nature Precedings finden Sie einige Anregungen.


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das ist ein netter Artikel, aber es würde helfen, einige der Informationen in Ihrer Antwort zusammenzufassen
Abe

Hallo @Abe, ja, das wäre hilfreicher. Ich habe den Artikel selbst nicht gelesen, habe ihn erst gestern gefunden und mich nicht besonders für das Thema interessiert. Ich dachte, ich würde sowieso teilen.
Charlie

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