Gibt es ein R-Paket (oder sogar eine Basis-R-Funktion), das die Fisher- oder Stouffer-Methode zum Kombinieren von p-Werten implementiert ? Das Codieren sollte fast trivial sein, aber ich würde lieber ein Paket verwenden (und zitieren).
Beispielcode in dieser Frage: Fischers Methode zum Kämmen von p-Werten - was ist mit dem unteren Schwanz?
Antworten:
Das metapPaket von Michael Dewey implementiert viele Methoden zum Kombinieren von p-Werten:
sumlog: Fischers Methodesumz: Sieht aus wie die Methode von Stouffer (mit Gewichten), dies wird in der Dokumentation der Funktion nicht explizit erwähnt, aber in der Entwurfsvignette bestätigt (die noch nicht Teil des Pakets ist).meanp: Warum nicht einfach mitteln, wenn p-Werte kombiniert werden?Es gibt auch die combine.testFunktion im survcompPaket (auf Bioconductor). Implementiert die Fisher- und Stouffer-Methode sowie die Logit-Methode.
survcompFunktioniert auch im Randfall eines einzelnen p-Werts, behandelt fehlende Werte konsistenter mit der Basis r und fördert Beiträge durch Bereitstellung eines offiziellen Repos.