Ihre Frage ist etwas verwirrend. Sie fragen nach einem Aufenthalt in Tokio, aber es gibt keine Hot Spring Inns ("Ryokan", wie andere bereits erwähnt haben), die ich in Tokio kenne. In Tokio ist wahrscheinlich eines der Gästehäuser die beste Wahl für ein authentisches japanisches Erlebnis.
Sie können jedoch Ryokan in Kyoto finden, obwohl diese Stadt nicht besonders berühmt für ihre heißen Quellen ist.
Wenn Sie einen guten Ryokan in der Nähe von Tokio wollen, würde ich den Ferienort Hakone in der Nähe des Berges empfehlen. Fuji. Dort gibt es viele Ryokans verschiedener Preisklassen, viele mit eigenen Thermalbädern. Es ist ein wenig touristisch, aber auf die Japaner ausgerichtet, nicht auf Ausländer.
Ich mag auch Nikko, das in den Bergen auf der anderen Seite von Tokio liegt und mehrere berühmte Tempel hat.
Und wenn Sie ein abenteuerlustiger Typ sind, würde ich sogar Kusatsu (Präfektur Gunma, NICHT Shiga) empfehlen, einen kleinen Ferienort in den Bergen. Sie haben dort mehrere "berühmte" öffentliche Thermalbäder ("Onsen") und es ist eine der besten Erinnerungen, die ich an Japan habe, nachdem ich ein Jahr dort gelebt habe. Es ist nicht so leicht zu erreichen wie die anderen. Einige japanische Freunde haben uns dorthin gebracht; Ich erinnere mich nur, dass wir einen Hochgeschwindigkeitszug vom Ueno-Bahnhof in Tokio genommen haben und danach ein paar Meilen mit einem lokalen Bus gefahren sind. Aber es ist definitiv die Mühe wert, wenn Sie die Zeit haben.
Schließlich würde ich empfehlen, eines der vielen Reisebüros in ganz Tokio zu nutzen. Ich weiß nicht, ob Sie das wissen, aber der Tourismus ist ein GROSSES Geschäft in Japan, und es gibt überall Reisebüros, normalerweise an den Bahnhöfen. Sie bieten günstige Pauschalangebote für Orte in ganz Japan (und der Welt) mit großartigem Service (Service ist auch eine große Sache im Land der aufgehenden Sonne). Ich könnte mir vorstellen, dass die Agenturen an einer der großen U-Bahn-Stationen (wie Shibuya, Shinjuku oder Tokyo) Englisch sprechen und Ihre Reservierungen vornehmen und Ihre Bahntickets und alles, was Sie sonst noch brauchen, buchen können.
Hoffe das hilft, tut mir leid so umständlich zu sein, aber Japan ist einer meiner Lieblingsorte ... :-)