Chi-Quadrat-Test mit 0 erwarteten Werten

Meine Kontingenztabelle:

         heterozygous homozygous.minor homozygous.major
observed    2                 0               3
expected    0                 0               5

Die erwartete Population besteht nur aus dem AA-Genotyp, aber in der beobachteten Population beobachten wir 2 AB-Genotypen. Um das Chi-Quadrat dafür zu berechnen, würde ich einfach die beiden Fälle ignorieren, in denen das erwartete = 0 ist? Also würde ich tun:

$(3-5)^2/5=0.8$

chi-squared

— crysis405
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Wenn das Erwartete tatsächlich Null ist und das Beobachtete nicht Null ist, wäre der Chi-Quadrat-Wert unendlich. Dies ist so, wie es sein sollte: Sie beobachten etwas, das laut Modell unmöglich ist, also sollte es automatisch ablehnen. Vielleicht sollten Sie mehr darüber sagen, wie die erwarteten Werte erhalten wurden.

— Glen_b -State Monica

Ob es unendlich oder 1,6 wäre, hängt davon ab, ob die erwarteten Werte 0 sind, weil sie unmöglich sind oder aus einem anderen Grund. Ich stimme Ihrem letzten Satz zu.

— Peter Flom

@PeterFlom Ich bezog mich auf die Zelle ganz links, die zu einer Statistik von .

χ^{2}

$\chi^2$

(2 - 0)^{2} / 0 = 4 / 0

$(2-0)^2/0 = 4/0$

— Glen_b -State Monica

Der springende Punkt bleibt hier, wie die erwarteten Frequenzen berechnet wurden. Ansonsten deuten alle Beweise darauf hin, dass etwas vermeintlich Unmögliches passiert ist. Sie haben die Wahl, wie Sie dies melden möchten: Sie möchten möglicherweise sagen, dass die Hypothese zurückgewiesen werden muss, oder Sie möchten möglicherweise sagen, dass der Test einfach nicht anwendbar ist, was möglicherweise wahrscheinlicher ist.

— Nick Cox

Ja ihr habt recht. Die beiden Heterozygoten sind Mendelsche Fehler, die es unmöglich machen.

— crysis405

Sie würden die Nullen nur ignorieren, wenn es einen Grund (keinen statistischen) dafür gibt. Aber das Einschließen würde nur die Freiheitsgrade ändern, da (0-0) natürlich 0 ist. Ich bin mir jedoch nicht sicher, ob Sie hier überhaupt ein Chi-Quadrat wollen. Es würde davon abhängen, warum Sie nur einen AA-Genotyp erwartet haben.

Wenn Sie tun Chi-Quadrat wollen, wäre es

$\frac{(2-0)^2}{0} + \frac{(3-5)^2}{5} = \infty$

— Peter Flom
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Die ChiSquare-Näherung ist nicht gültig, wenn die Zellenzahlen klein sind. Probieren Sie den genauen Fisher-Test mit einer multinomialen Wahrscheinlichkeitsverteilung aus.

Wiki: https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%27s_exact_test

— RL Rogers
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