Setup / mach es langsam
Erstens läuft das Programm ungefähr zur gleichen Zeit, unabhängig davon:
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_shuffled
11558358
real 0m0.705s
user 0m0.692s
sys 0m0.013s
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_sorted
24986825
real 0m0.722s
user 0m0.711s
sys 0m0.012s
Die meiste Zeit wird in der Eingangsschleife verbracht. Aber da wir an der interessiert sind grouped_sum()
, lassen Sie uns das ignorieren.
Wenn Sie die Benchmark-Schleife von 10 auf 1000 Iterationen ändern, wird grouped_sum()
die Laufzeit dominiert:
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_shuffled
1131838420
real 0m1.828s
user 0m1.811s
sys 0m0.016s
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_sorted
2494032110
real 0m3.189s
user 0m3.169s
sys 0m0.016s
perf diff
Jetzt können wir perf
die heißesten Stellen in unserem Programm finden.
sumspeed$ perf record ./sum_groups < groups_shuffled
1166805982
[ perf record: Woken up 1 times to write data ]
[kernel.kallsyms] with build id 3a2171019937a2070663f3b6419330223bd64e96 not found, continuing without symbols
Warning:
Processed 4636 samples and lost 6.95% samples!
[ perf record: Captured and wrote 0.176 MB perf.data (4314 samples) ]
sumspeed$ perf record ./sum_groups < groups_sorted
2571547832
[ perf record: Woken up 2 times to write data ]
[kernel.kallsyms] with build id 3a2171019937a2070663f3b6419330223bd64e96 not found, continuing without symbols
[ perf record: Captured and wrote 0.420 MB perf.data (10775 samples) ]
Und der Unterschied zwischen ihnen:
sumspeed$ perf diff
[...]
# Event 'cycles:uppp'
#
# Baseline Delta Abs Shared Object Symbol
# ........ ......... ................... ........................................................................
#
57.99% +26.33% sum_groups [.] main
12.10% -7.41% libc-2.23.so [.] _IO_getc
9.82% -6.40% libstdc++.so.6.0.21 [.] std::num_get<char, std::istreambuf_iterator<char, std::char_traits<c
6.45% -4.00% libc-2.23.so [.] _IO_ungetc
2.40% -1.32% libc-2.23.so [.] _IO_sputbackc
1.65% -1.21% libstdc++.so.6.0.21 [.] 0x00000000000dc4a4
1.57% -1.20% libc-2.23.so [.] _IO_fflush
1.71% -1.07% libstdc++.so.6.0.21 [.] std::istream::sentry::sentry
1.22% -0.77% libstdc++.so.6.0.21 [.] std::istream::operator>>
0.79% -0.47% libstdc++.so.6.0.21 [.] __gnu_cxx::stdio_sync_filebuf<char, std::char_traits<char> >::uflow
[...]
Mehr Zeit in main()
, was sich wahrscheinlich grouped_sum()
eingefügt hat. Großartig, vielen Dank, perf.
perf annotieren
Gibt es einen Unterschied, wo die Zeit drinnen verbracht wirdmain()
?
Gemischt:
sumspeed$ perf annotate -i perf.data.old
[...]
│ // This is the function whose performance I am interested in
│ void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int* p_out) {
│ for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
│180: xor %eax,%eax
│ test %rdi,%rdi
│ ↓ je 1a4
│ nop
│ p_out[p_g[i]] += p_x[i];
6,88 │190: movslq (%r9,%rax,4),%rdx
58,54 │ mov (%r8,%rax,4),%esi
│ #include <chrono>
│ #include <vector>
│
│ // This is the function whose performance I am interested in
│ void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int* p_out) {
│ for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
3,86 │ add $0x1,%rax
│ p_out[p_g[i]] += p_x[i];
29,61 │ add %esi,(%rcx,%rdx,4)
[...]
Sortiert:
sumspeed$ perf annotate -i perf.data
[...]
│ // This is the function whose performance I am interested in
│ void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int* p_out) {
│ for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
│180: xor %eax,%eax
│ test %rdi,%rdi
│ ↓ je 1a4
│ nop
│ p_out[p_g[i]] += p_x[i];
1,00 │190: movslq (%r9,%rax,4),%rdx
55,12 │ mov (%r8,%rax,4),%esi
│ #include <chrono>
│ #include <vector>
│
│ // This is the function whose performance I am interested in
│ void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int* p_out) {
│ for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
0,07 │ add $0x1,%rax
│ p_out[p_g[i]] += p_x[i];
43,28 │ add %esi,(%rcx,%rdx,4)
[...]
Nein, es dominieren die gleichen zwei Anweisungen. Sie dauern also in beiden Fällen lange, sind aber noch schlimmer, wenn die Daten sortiert werden.
perf stat
Okay. Wir sollten sie jedoch gleich oft ausführen, daher muss jede Anweisung aus irgendeinem Grund langsamer werden. Mal sehen, was perf stat
sagt.
sumspeed$ perf stat ./sum_groups < groups_shuffled
1138880176
Performance counter stats for './sum_groups':
1826,232278 task-clock (msec) # 0,999 CPUs utilized
72 context-switches # 0,039 K/sec
1 cpu-migrations # 0,001 K/sec
4 076 page-faults # 0,002 M/sec
5 403 949 695 cycles # 2,959 GHz
930 473 671 stalled-cycles-frontend # 17,22% frontend cycles idle
9 827 685 690 instructions # 1,82 insn per cycle
# 0,09 stalled cycles per insn
2 086 725 079 branches # 1142,639 M/sec
2 069 655 branch-misses # 0,10% of all branches
1,828334373 seconds time elapsed
sumspeed$ perf stat ./sum_groups < groups_sorted
2496546045
Performance counter stats for './sum_groups':
3186,100661 task-clock (msec) # 1,000 CPUs utilized
5 context-switches # 0,002 K/sec
0 cpu-migrations # 0,000 K/sec
4 079 page-faults # 0,001 M/sec
9 424 565 623 cycles # 2,958 GHz
4 955 937 177 stalled-cycles-frontend # 52,59% frontend cycles idle
9 829 009 511 instructions # 1,04 insn per cycle
# 0,50 stalled cycles per insn
2 086 942 109 branches # 655,014 M/sec
2 078 204 branch-misses # 0,10% of all branches
3,186768174 seconds time elapsed
Nur eines fällt auf: Stalled-Cycles-Frontend .
Okay, die Anweisungspipeline blockiert. Im Frontend. Was genau das bedeutet, variiert wahrscheinlich zwischen den Mikroarchitekturen.
Ich habe allerdings eine Vermutung. Wenn Sie großzügig sind, können Sie es sogar eine Hypothese nennen.
Hypothese
Durch Sortieren der Eingabe erhöhen Sie die Lokalität der Schreibvorgänge. In der Tat werden sie sehr lokal sein; Fast alle Ergänzungen, die Sie vornehmen, werden an dieselbe Stelle wie die vorherige geschrieben.
Das ist großartig für den Cache, aber nicht großartig für die Pipeline. Sie führen Datenabhängigkeiten ein und verhindern, dass die nächste Additionsanweisung fortgesetzt wird, bis die vorherige Addition abgeschlossen ist (oder das Ergebnis auf andere Weise für nachfolgende Anweisungen verfügbar gemacht hat ).
Das ist dein Problem.
Ich glaube.
Es reparieren
Mehrere Summenvektoren
Versuchen wir mal etwas. Was wäre, wenn wir mehrere Summenvektoren verwenden würden, bei jeder Addition zwischen ihnen wechseln und diese am Ende zusammenfassen würden? Es kostet uns ein wenig Lokalität, sollte aber die Datenabhängigkeiten beseitigen.
(Der Code ist nicht schön; verurteile mich nicht, Internet !!)
#include <iostream>
#include <chrono>
#include <vector>
#ifndef NSUMS
#define NSUMS (4) // must be power of 2 (for masking to work)
#endif
// This is the function whose performance I am interested in
void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int** p_out) {
for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
p_out[i & (NSUMS-1)][p_g[i]] += p_x[i];
}
}
int main() {
std::vector<int> values;
std::vector<int> groups;
std::vector<int> sums[NSUMS];
int n_groups = 0;
// Read in the values and calculate the max number of groups
while(std::cin) {
int value, group;
std::cin >> value >> group;
values.push_back(value);
groups.push_back(group);
if (group >= n_groups) {
n_groups = group+1;
}
}
for (int i=0; i<NSUMS; ++i) {
sums[i].resize(n_groups);
}
// Time grouped sums
std::chrono::system_clock::time_point start = std::chrono::system_clock::now();
int* sumdata[NSUMS];
for (int i = 0; i < NSUMS; ++i) {
sumdata[i] = sums[i].data();
}
for (int i = 0; i < 1000; ++i) {
grouped_sum(values.data(), groups.data(), values.size(), sumdata);
}
for (int i = 1; i < NSUMS; ++i) {
for (int j = 0; j < n_groups; ++j) {
sumdata[0][j] += sumdata[i][j];
}
}
std::chrono::system_clock::time_point end = std::chrono::system_clock::now();
std::cout << (end - start).count() << " with NSUMS=" << NSUMS << std::endl;
return 0;
}
(Oh, und ich habe auch die Berechnung für n_groups korrigiert; sie war um eins verschoben.)
Ergebnisse
Nachdem ich mein Makefile so konfiguriert habe, dass -DNSUMS=...
es dem Compiler ein Argument gibt, kann ich Folgendes tun:
sumspeed$ for n in 1 2 4 8 128; do make -s clean && make -s NSUMS=$n && (perf stat ./sum_groups < groups_shuffled && perf stat ./sum_groups < groups_sorted) 2>&1 | egrep '^[0-9]|frontend'; done
1134557008 with NSUMS=1
924 611 882 stalled-cycles-frontend # 17,13% frontend cycles idle
2513696351 with NSUMS=1
4 998 203 130 stalled-cycles-frontend # 52,79% frontend cycles idle
1116188582 with NSUMS=2
899 339 154 stalled-cycles-frontend # 16,83% frontend cycles idle
1365673326 with NSUMS=2
1 845 914 269 stalled-cycles-frontend # 29,97% frontend cycles idle
1127172852 with NSUMS=4
902 964 410 stalled-cycles-frontend # 16,79% frontend cycles idle
1171849032 with NSUMS=4
1 007 807 580 stalled-cycles-frontend # 18,29% frontend cycles idle
1118732934 with NSUMS=8
881 371 176 stalled-cycles-frontend # 16,46% frontend cycles idle
1129842892 with NSUMS=8
905 473 182 stalled-cycles-frontend # 16,80% frontend cycles idle
1497803734 with NSUMS=128
1 982 652 954 stalled-cycles-frontend # 30,63% frontend cycles idle
1180742299 with NSUMS=128
1 075 507 514 stalled-cycles-frontend # 19,39% frontend cycles idle
Die optimale Anzahl von Summenvektoren hängt wahrscheinlich von der Pipeline-Tiefe Ihrer CPU ab. Meine 7 Jahre alte Ultrabook-CPU kann die Pipeline wahrscheinlich mit weniger Vektoren maximieren, als eine neue schicke Desktop-CPU benötigen würde.
Mehr ist natürlich nicht unbedingt besser. Als ich mit 128 Summenvektoren verrückt wurde, litten wir mehr unter Cache-Fehlern - was sich daran zeigt, dass die gemischte Eingabe langsamer als sortiert wurde, wie Sie es ursprünglich erwartet hatten. Wir haben den Kreis geschlossen! :) :)
Summe pro Gruppe im Register
(Dies wurde in einer Bearbeitung hinzugefügt)
Agh, Nerd hat geschnippt ! Wenn Sie wissen, dass Ihre Eingabe sortiert wird und Sie nach noch mehr Leistung suchen, ist das folgende Umschreiben der Funktion (ohne zusätzliche Summenarrays) zumindest auf meinem Computer noch schneller.
// This is the function whose performance I am interested in
void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int* p_out) {
int i = n-1;
while (i >= 0) {
int g = p_g[i];
int gsum = 0;
do {
gsum += p_x[i--];
} while (i >= 0 && p_g[i] == g);
p_out[g] += gsum;
}
}
Der Trick in diesem Fall besteht darin, dass der Compiler die gsum
Variable, die Summe der Gruppe, in einem Register speichern kann. Ich vermute (kann aber sehr falsch sein), dass dies schneller ist, da die Rückkopplungsschleife in der Pipeline hier kürzer sein kann und / oder weniger Speicherzugriffe. Ein guter Branchenprädiktor macht die zusätzliche Überprüfung der Gruppengleichheit billig.
Ergebnisse
Es ist schrecklich für gemischte Eingaben ...
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_shuffled
2236354315
real 0m2.932s
user 0m2.923s
sys 0m0.009s
... ist aber rund 40% schneller als meine "viele Summen" -Lösung für sortierte Eingaben.
sumspeed$ time ./sum_groups < groups_sorted
809694018
real 0m1.501s
user 0m1.496s
sys 0m0.005s
Viele kleine Gruppen sind langsamer als einige große. Ob dies die schnellere Implementierung ist oder nicht, hängt also wirklich von Ihren Daten ab. Und wie immer auf Ihrem CPU-Modell.
Vektoren mit mehreren Summen, mit Versatz anstelle von Bitmaskierung
Sopel schlug vier abgewickelte Ergänzungen als Alternative zu meinem Bitmaskierungsansatz vor. Ich habe eine verallgemeinerte Version ihres Vorschlags implementiert, die unterschiedlich umgehen kann NSUMS
. Ich zähle darauf, dass der Compiler die innere Schleife für uns abwickelt (was zumindest für ihn der Fall war NSUMS=4
).
#include <iostream>
#include <chrono>
#include <vector>
#ifndef NSUMS
#define NSUMS (4) // must be power of 2 (for masking to work)
#endif
#ifndef INNER
#define INNER (0)
#endif
#if INNER
// This is the function whose performance I am interested in
void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int** p_out) {
size_t i = 0;
int quadend = n & ~(NSUMS-1);
for (; i < quadend; i += NSUMS) {
for (int k=0; k<NSUMS; ++k) {
p_out[k][p_g[i+k]] += p_x[i+k];
}
}
for (; i < n; ++i) {
p_out[0][p_g[i]] += p_x[i];
}
}
#else
// This is the function whose performance I am interested in
void grouped_sum(int* p_x, int *p_g, int n, int** p_out) {
for (size_t i = 0; i < n; ++i) {
p_out[i & (NSUMS-1)][p_g[i]] += p_x[i];
}
}
#endif
int main() {
std::vector<int> values;
std::vector<int> groups;
std::vector<int> sums[NSUMS];
int n_groups = 0;
// Read in the values and calculate the max number of groups
while(std::cin) {
int value, group;
std::cin >> value >> group;
values.push_back(value);
groups.push_back(group);
if (group >= n_groups) {
n_groups = group+1;
}
}
for (int i=0; i<NSUMS; ++i) {
sums[i].resize(n_groups);
}
// Time grouped sums
std::chrono::system_clock::time_point start = std::chrono::system_clock::now();
int* sumdata[NSUMS];
for (int i = 0; i < NSUMS; ++i) {
sumdata[i] = sums[i].data();
}
for (int i = 0; i < 1000; ++i) {
grouped_sum(values.data(), groups.data(), values.size(), sumdata);
}
for (int i = 1; i < NSUMS; ++i) {
for (int j = 0; j < n_groups; ++j) {
sumdata[0][j] += sumdata[i][j];
}
}
std::chrono::system_clock::time_point end = std::chrono::system_clock::now();
std::cout << (end - start).count() << " with NSUMS=" << NSUMS << ", INNER=" << INNER << std::endl;
return 0;
}
Ergebnisse
Zeit zu messen. Beachten Sie, dass ich, seit ich gestern in / tmp gearbeitet habe, nicht genau die gleichen Eingabedaten habe. Daher sind diese Ergebnisse nicht direkt mit den vorherigen vergleichbar (aber wahrscheinlich nahe genug).
sumspeed$ for n in 2 4 8 16; do for inner in 0 1; do make -s clean && make -s NSUMS=$n INNER=$inner && (perf stat ./sum_groups < groups_shuffled && perf stat ./sum_groups < groups_sorted) 2>&1 | egrep '^[0-9]|frontend'; done; done1130558787 with NSUMS=2, INNER=0
915 158 411 stalled-cycles-frontend # 16,96% frontend cycles idle
1351420957 with NSUMS=2, INNER=0
1 589 408 901 stalled-cycles-frontend # 26,21% frontend cycles idle
840071512 with NSUMS=2, INNER=1
1 053 982 259 stalled-cycles-frontend # 23,26% frontend cycles idle
1391591981 with NSUMS=2, INNER=1
2 830 348 854 stalled-cycles-frontend # 45,35% frontend cycles idle
1110302654 with NSUMS=4, INNER=0
890 869 892 stalled-cycles-frontend # 16,68% frontend cycles idle
1145175062 with NSUMS=4, INNER=0
948 879 882 stalled-cycles-frontend # 17,40% frontend cycles idle
822954895 with NSUMS=4, INNER=1
1 253 110 503 stalled-cycles-frontend # 28,01% frontend cycles idle
929548505 with NSUMS=4, INNER=1
1 422 753 793 stalled-cycles-frontend # 30,32% frontend cycles idle
1128735412 with NSUMS=8, INNER=0
921 158 397 stalled-cycles-frontend # 17,13% frontend cycles idle
1120606464 with NSUMS=8, INNER=0
891 960 711 stalled-cycles-frontend # 16,59% frontend cycles idle
800789776 with NSUMS=8, INNER=1
1 204 516 303 stalled-cycles-frontend # 27,25% frontend cycles idle
805223528 with NSUMS=8, INNER=1
1 222 383 317 stalled-cycles-frontend # 27,52% frontend cycles idle
1121644613 with NSUMS=16, INNER=0
886 781 824 stalled-cycles-frontend # 16,54% frontend cycles idle
1108977946 with NSUMS=16, INNER=0
860 600 975 stalled-cycles-frontend # 16,13% frontend cycles idle
911365998 with NSUMS=16, INNER=1
1 494 671 476 stalled-cycles-frontend # 31,54% frontend cycles idle
898729229 with NSUMS=16, INNER=1
1 474 745 548 stalled-cycles-frontend # 31,24% frontend cycles idle
Ja, die innere Schleife mit NSUMS=8
ist die schnellste auf meinem Computer. Im Vergleich zu meinem "lokalen Gsum" -Ansatz hat es auch den zusätzlichen Vorteil, dass es für die gemischte Eingabe nicht schrecklich wird.
Interessant zu bemerken: NSUMS=16
wird schlimmer als NSUMS=8
. Dies kann daran liegen, dass immer mehr Cache-Fehler auftreten oder dass wir nicht über genügend Register verfügen, um die innere Schleife ordnungsgemäß abzuwickeln.
.at()
oder einen Debug-Modusoperator[]
, der Grenzen setzt Überprüfen Sie, was Sie sehen würden.