Wie verwende ich R mit Google Colaboratory?

Google Colaboratory unterstützt Python Version 2.7 und 3.6

Ich sehe ein Beispiel, wie man Swift vor einiger Zeit in Colab verwendet.

Heute bin ich zufällig gelaufen

!jupyter-kernelspec list

Und einen neuen Kernel gefunden: IRkernel

Available kernels:
  ir         /usr/local/share/jupyter/kernels/ir
  python2    /usr/local/share/jupyter/kernels/python2
  python3    /usr/local/share/jupyter/kernels/python3
  swift      /usr/local/share/jupyter/kernels/swift

Ist es jetzt möglich, R auch in Colab zu verwenden? Kein Aufwand bei der Installation des R-Kernels?

Ja.

Verwenden Sie für ein neues R-Notebook diesen Link . (Abkürzung ist colab.to/r )

Sie können aus IRkernel-Demos lernen, z. B. demo.ipynb

Speichern Sie eine Kopie in Ihrem Google Drive und nehmen Sie die erforderlichen Änderungen vor.

2 weitere Demos:

• Display.ipynb zeigt, wie HTML-Bilder angezeigt werden.
• Comm_Demo.ipynb zeigt, wie zwischen R und JavaScript kommuniziert wird.

Weitere Details finden Sie in IRkernel Github .

Wenn Sie Python und R zusammen verwenden möchten, können Sie für einige Zellen R magic verwenden.

# activate R magic
%load_ext rpy2.ipython

Wann immer Sie R verwenden möchten, beginnen Sie die Zelle mit %%R

%%R
x <- 42
print(x)

Weitere Details in der rpy2-Dokumentation

Öffnen Sie diesen Link in Ihrem Browser, um ein neues Notizbuch mit R Kernel zu erstellen

https://colab.research.google.com/notebook#create=true&language=r

Um eine frühere Antwort zu erweitern, können Sie Datenrahmen zwischen dem R- und dem Python-Kernel verschieben, damit Sie mit beiden im selben Notizbuch arbeiten können (wenn Sie beispielsweise Daten mit Pandas laden möchten, verarbeiten Sie sie mit einem R-Paket: und dann mit Bokeh planen).

# Pandas dataframe to R data frame
!pip3 install rpy2
%load_ext rpy2.ipython
%R -i df

# R data frame to Pandas dataframe
%R seq.data <- read.delim('sequence.index', header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE)
seq_data = %R seq.data

Update: Das funktioniert nicht mehr (Juli 2020) .

Der obige Link zu den obigen Antworten führt direkt zum R-Notebook. Dort können Sie zwischen R und Python wechseln. Es ist seltsam, dass Google die Dienste einfach so ändert. Daher ist Stackoverflow keine großartige Plattform, um Tools zu fördern, die von gewinnbringenden / datenverkaufenden Unternehmen entwickelt wurden.

Alte Antwort:

Wenn Sie ab sofort Runtimeauf die Menüleiste klicken und dann auswählen Change Runtime Type, können Sie zwischen R und Python wählen.

***** Arbeiten ab Freitag, 13. November 2020

Gehen Sie zu dieser URL https://colab.to/r, während Sie bei colab angemeldet sind, und das sollte es tun.

Sie können überprüfen, ob R in Runtime -> Laufzeittyp ändern, es sollte jedoch bereits eingerichtet sein.

So mounten Sie Google Drive:

install.packages("googledrive")
library("googledrive")

if (file.exists("/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/google/colab/_ipython.py")){ 
  install.packages("R.utils")
  library("R.utils")
  library("httr")
  my_check <- function() {return(TRUE)}
  reassignInPackage("is_interactive", pkgName = "httr", my_check)
  options(rlang_interactive=TRUE)
}                                                                                    

Und authentifizieren Sie Google Drive

drive_auth(use_oob = TRUE, cache = TRUE)