Generieren eines PNG mit matplotlib, wenn DISPLAY nicht definiert ist

Ich versuche, networkx mit Python zu verwenden. Wenn ich dieses Programm starte, wird dieser Fehler angezeigt. Fehlt etwas?

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Ich erhalte jetzt einen anderen Fehler:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Ich erhalte jetzt einen anderen Fehler:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Das Hauptproblem ist, dass matplotlib (auf Ihrem System) standardmäßig ein x-using-Backend auswählt. Ich hatte gerade das gleiche Problem auf einem meiner Server. Die Lösung für mich bestand darin, den folgenden Code an einer Stelle hinzuzufügen, die vor jedem anderen Import von Pylab / Matplotlib / Pyplot gelesen wird :

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

Die Alternative besteht darin, es in Ihrem .matplotlibrc einzustellen

Nur als Ergänzung zu Reinouts Antwort.

Die dauerhafte Möglichkeit, diese Art von Problem zu lösen, besteht darin, die .matplotlibrc-Datei zu bearbeiten. Finden Sie es über

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

Ändern Sie dann das Backend in dieser Datei in backend : Agg. Das ist es.

Die saubere Antwort ist, sich ein wenig Zeit zu nehmen, um Ihre Ausführungsumgebung richtig vorzubereiten.

Die erste Technik müssen Sie Ihre Ausführungsumgebung vorzubereiten , ist eine verwenden matplotlibrcDatei, wie klug von Chris F. empfohlen , Einstellung

backend : Agg

in dieser Datei. Sie können sogar ohne Codeänderungen steuern, wie und wo matplotlib die matplotlibrcDatei sucht und findet .

Die zweite Technik, die Sie zur Vorbereitung Ihrer Ausführungsumgebung benötigen, besteht darin, die MPLBACKENDUmgebungsvariable zu verwenden (und Ihre Benutzer zu informieren, diese zu verwenden):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

Dies ist praktisch, da Sie nicht einmal eine andere Datei auf der Festplatte bereitstellen müssen, damit dies funktioniert. Ich habe diesen Ansatz beispielsweise beim Testen der kontinuierlichen Integration und beim Ausführen auf Remotecomputern ohne Anzeige angewendet.

Das Hardcodieren Ihres Matplotlib-Backends auf "Agg" in Ihrem Python-Code ist wie das Schlagen eines quadratischen Stifts in ein rundes Loch mit einem großen Hammer, wenn Sie stattdessen einfach Matplotlib hätten sagen können, dass es ein quadratisches Loch sein muss.

Ich habe den Fehler bei der Verwendung von matplotlib über Spark erhalten. matplotlib.use('Agg')funktioniert bei mir nicht Am Ende funktioniert der folgende Code für mich. Mehr hier

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

Ich werde nur wiederholen, was @Ivo Bosticky gesagt hat, was übersehen werden kann. Setzen Sie diese Zeilen an den SEHREN Anfang der py-Datei.

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

Oder man würde Fehler bekommen

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923: UserWarning: Dieser Aufruf von matplotlib.use () hat keine Auswirkung
weil das Backend bereits ausgewählt wurde;
matplotlib.use () muss * vor * pylab, matplotlib.pyplot, * aufgerufen werden

Dadurch werden alle Anzeigeprobleme behoben

Ich fand, dass dieses Snippet gut funktioniert, wenn zwischen X- und No-X-Umgebungen gewechselt wird.

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Wenn Sie sich beim Server anmelden, um den Code auszuführen, verwenden Sie stattdessen Folgendes:

ssh -X username@servername

das -Xwird die keine Anzeige loswerden Namen erhalten und keine $ DISPLAY Umgebungsvariable Fehler

:) :)

Auf welchem ​​System bist du? Es sieht so aus, als hätten Sie ein System mit X11, aber die Umgebungsvariable DISPLAY wurde nicht richtig eingestellt. Führen Sie den folgenden Befehl aus und führen Sie das Programm erneut aus:

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Für mich geht das.

Sie müssen auch prüfen, ob Ihr aktueller Benutzer berechtigt ist, eine Verbindung zum X-Display herzustellen. In meinem Fall durfte root das nicht und matplotlib beschwerte sich mit demselben Fehler.

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

Quelle: http://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

Um sicherzustellen, dass Ihr Code unter Windows, Linux und OSX sowie für Systeme mit und ohne Anzeige portierbar ist, würde ich folgendes Snippet vorschlagen:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Bildnachweis: https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

Für die Google Cloud Machine Learning Engine:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

Und dann zum Drucken in eine Datei:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

und um das PDF zu erstellen:

multi_page(report_name)