pydot- und graphviz-Fehler: dot_parser konnte nicht importiert werden, das Laden von Punktdateien ist nicht möglich

Wenn ich einen sehr einfachen Code mit pydot ausführe

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Es gibt mir die Fehlermeldung:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Ich benutze Python 2.7.3

Antwort für pydot >= 1.1:

Die Inkompatibilität von (upstream) pydotwird von fest 6dff94b3f1 , und somit pydot >= 1.1wird mit kompatibelpyparsing >= 1.5.7 .

Antwort gilt für pydot <= 1.0.28:

Für alle anderen, die darauf stoßen, ist dies auf die Änderungen beim Pyparsing von 1.x auf 2.x zurückzuführen. Um pydot mit pip zu installieren, installieren Sie zuerst die ältere Version von pyparsing:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

Wenn Sie nicht pyparsingmit pip, sondern mit installiert setup.pyhaben, sehen Sie sich diese Lösung an, um das Paket zu deinstallieren. Danke @qtips.

Im Pip-Repo gibt es ein neues Paket namens pydot2, das mit pyparsing2 korrekt funktioniert. Ich konnte meine Pakete nicht downgraden, da matplotlib vom neueren Pyparsing-Paket abhängt.

Hinweis: python2.7 von macports

pydot verwendete eine private Modulvariable (_noncomma) aus pyparsing. Das folgende Diff behebt es für Pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Ich gabelte das Pydot-Repository [1], wendete den Gabi Davar-Patch und einige Änderungen an, um Python-3 zu unterstützen. Das Paket ist im PyPI [2] verfügbar.

Prost

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Siehe den folgenden Link: http://infidea.net/troubleshooter-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Die Lösung bestand nicht darin, pydot von irgendwoher zu installieren, sondern "python-pydot" aus offiziellen Ubuntu-Repositories.

Es gibt jetzt mindestens zwei weitere Versionen, die PyParsing-2 und Python-3 unterstützen:

• PyDotPlus von Carlos Jenkins mit einem schönen Travis Buildbot und einer ausgefallenen Dokumentation . Sie müssen jedoch den Ordnernamen von in ändern site-packages\pydotplus, site-packages\pydotdamit er mit vorhandenen Programmen funktioniert, die pydot importieren.
• pydot3k von bmcorser . Hat leider nicht funktioniert!
• prologic / pydot von James Mills verlinkt von der offiziellen pydot Google Codepage als ...

  Ein Zweig für Python 3-Kompatibilität

• und hier ist ein funktionierender Link zu David Villas pydot2, der gut funktioniert: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

Ich hatte das Problem wieder und meine obige Lösung funktionierte nicht. Wenn dies für Sie zutrifft und Sie Anaconda auch auf einem Mac mit El Capitan verwenden, versuchen Sie Folgendes:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Was ich am Ende nach so vielen Versuchen von dem gemacht habe, was ich hier gesehen habe (Pseudosequenz, damit es für networkx funktioniert):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Dies funktionierte bei mir (Mac OS X 10.9 mit Python 2.7.10 unter Anaconda):

conda uninstall pydot

Dann,

conda install pydot

Pyparsing wird dann bei der Installation von pydot herabgestuft (von 2.x auf 1.5.7). Zukünftige Googler: Dadurch konnte ich Theano korrekt installieren und importieren.

Unter OSX Mavericks hat Folgendes den Trick gemacht ... Ich habe den gleichen Fehler erhalten, aber unten gab es auch eine Beschwerde, dass die ausführbare Datei von graphviz nicht vorhanden war ... Ich denke, das Problem war, dass ich graphviz vor den anderen Modulen installiert hatte?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Wenn andere Lösungen nicht funktionieren, ist dies eine schnelle und schmutzige Methode, um das Problem zu lösen:

Dieses Beispiel stammt aus Python 2.7 unter Ubuntu 16.04.

Bearbeiten Sie die Datei python2.7 / site-packages / keras / utils / visualize_util.py und kommentieren Sie das folgende Codesegment.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () ist in neueren Versionen von pydot redundant, und der obige Aufruf funktioniert nicht.

Ich habe auch das Problem und meinen Pydot == 1.0.28 beim Pyparsing == 2.2.0 getroffen. Ich habe das Problem behoben, indem ich das neueste pydot 1.2.3 (tar.gz) von Google heruntergeladen und dann offline installiert habe. Als ich den Pydot in Ubuntu 14.04 aktualisiert habe, hieß es, der Pydot 1.0.28 sei die neueste Version. Deshalb lade ich von Google die Version 1.2.3 herunter.

Sie müssen Pyparsing von Version 2.x auf Version 1.5.7 herunterstufen, damit pydot ordnungsgemäß funktioniert.

Für Win-64 mit Conda funktionierte dies für mich:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Ich habe dann die 2.x-Version deaktiviert / deinstalliert und Pyparsing in meinem Skript neu geladen:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

So überprüfen Sie, ob die richtige Version ausgeführt wird:

print pyparsing.__version__